More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1988 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
512 aa  1055    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  61.33 
 
 
514 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  61.33 
 
 
514 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  57.56 
 
 
508 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  59.88 
 
 
515 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  59.88 
 
 
515 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  59.88 
 
 
515 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  59.22 
 
 
515 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  59.81 
 
 
515 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  59.42 
 
 
515 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  59.57 
 
 
520 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  57.03 
 
 
513 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  57.03 
 
 
513 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  57.03 
 
 
513 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  57.03 
 
 
513 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  57.03 
 
 
513 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  57.03 
 
 
513 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  57.03 
 
 
513 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  57.62 
 
 
514 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  52.25 
 
 
511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  48.22 
 
 
506 aa  534  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  46.27 
 
 
512 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  48.81 
 
 
506 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  48.42 
 
 
506 aa  521  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.72 
 
 
509 aa  310  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  36.8 
 
 
500 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  34.98 
 
 
548 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  33.86 
 
 
509 aa  290  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  32.15 
 
 
492 aa  289  9e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  32.15 
 
 
492 aa  289  9e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  33.01 
 
 
509 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  33.59 
 
 
495 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.41 
 
 
510 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.88 
 
 
501 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  31.58 
 
 
498 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  32.29 
 
 
503 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  35.24 
 
 
518 aa  276  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.87 
 
 
512 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  30.27 
 
 
505 aa  272  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.78 
 
 
504 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  33.07 
 
 
514 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  34.18 
 
 
502 aa  269  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.56 
 
 
496 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.66 
 
 
506 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  31.37 
 
 
500 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.92 
 
 
511 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  33.53 
 
 
497 aa  263  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  33.47 
 
 
512 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  30.84 
 
 
506 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  31.23 
 
 
511 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  31.23 
 
 
512 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  33.47 
 
 
513 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  32.67 
 
 
512 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  33.47 
 
 
513 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  31.21 
 
 
512 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  33.27 
 
 
513 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.48 
 
 
515 aa  256  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  33.27 
 
 
513 aa  256  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  33.27 
 
 
513 aa  256  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  33.27 
 
 
513 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  33.27 
 
 
513 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  33.27 
 
 
513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.11 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  31.01 
 
 
512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  32.95 
 
 
489 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  30.89 
 
 
530 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  30.22 
 
 
512 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.49 
 
 
499 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.49 
 
 
499 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  29.13 
 
 
505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  28.74 
 
 
495 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  30.95 
 
 
538 aa  240  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.02 
 
 
511 aa  239  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.52 
 
 
501 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  33.53 
 
 
518 aa  238  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  31.66 
 
 
498 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  30.89 
 
 
489 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  31.62 
 
 
517 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  31.62 
 
 
517 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  29.27 
 
 
513 aa  231  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  29.61 
 
 
489 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.79 
 
 
496 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  29.92 
 
 
503 aa  227  4e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  31.26 
 
 
519 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  32.74 
 
 
512 aa  226  8e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  32.43 
 
 
499 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.17 
 
 
512 aa  223  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  28.71 
 
 
511 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  29.04 
 
 
511 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  29.04 
 
 
511 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  30.29 
 
 
490 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  28.68 
 
 
493 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  28.68 
 
 
493 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  28.68 
 
 
493 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  31.42 
 
 
499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  28.85 
 
 
511 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  31.15 
 
 
487 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.89 
 
 
499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.06 
 
 
486 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  30.61 
 
 
511 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>