More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0653 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  98.42 
 
 
506 aa  1017    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
506 aa  1031    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  63.64 
 
 
506 aa  704    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  55.64 
 
 
511 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  54.46 
 
 
512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  48.42 
 
 
512 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  48.33 
 
 
514 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  46.95 
 
 
514 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  46.34 
 
 
508 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  46.17 
 
 
515 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  46.17 
 
 
515 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  46.17 
 
 
515 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  45.58 
 
 
515 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  45.78 
 
 
515 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  46.17 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  45.63 
 
 
513 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  45.63 
 
 
513 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  45.63 
 
 
513 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  45.63 
 
 
513 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  45.63 
 
 
513 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  45.63 
 
 
513 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  45.63 
 
 
513 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  45.97 
 
 
520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  45.94 
 
 
514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.29 
 
 
509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  36.29 
 
 
548 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  36.54 
 
 
503 aa  316  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  35.65 
 
 
510 aa  312  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  34.92 
 
 
502 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  35.63 
 
 
509 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  34.17 
 
 
500 aa  299  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  36.02 
 
 
498 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  35.7 
 
 
518 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  36.38 
 
 
492 aa  289  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  36.38 
 
 
492 aa  289  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  35.16 
 
 
538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  32.8 
 
 
512 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  36.03 
 
 
512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  32.95 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  33.6 
 
 
512 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  32.56 
 
 
505 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  33.4 
 
 
512 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  32.61 
 
 
514 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  33.53 
 
 
505 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  33 
 
 
511 aa  277  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  33 
 
 
512 aa  277  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.2 
 
 
496 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  31.82 
 
 
500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  32.23 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  32.5 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  34.65 
 
 
497 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33 
 
 
511 aa  266  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  35.24 
 
 
489 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.27 
 
 
504 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.47 
 
 
511 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.75 
 
 
501 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.81 
 
 
506 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.23 
 
 
530 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.29 
 
 
515 aa  257  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  31.3 
 
 
513 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  31.3 
 
 
513 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  31.3 
 
 
513 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  31.46 
 
 
513 aa  249  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.48 
 
 
498 aa  249  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  31.3 
 
 
513 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  31.65 
 
 
513 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  31.46 
 
 
513 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  33.8 
 
 
498 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  33.01 
 
 
493 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.67 
 
 
505 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  33.01 
 
 
493 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  33.01 
 
 
493 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  31.65 
 
 
513 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  31.21 
 
 
512 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  31.26 
 
 
512 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.91 
 
 
499 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.03 
 
 
501 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  30.43 
 
 
513 aa  240  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  33.86 
 
 
490 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  31.05 
 
 
506 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.37 
 
 
499 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  29.86 
 
 
495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  31.68 
 
 
489 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  29.61 
 
 
511 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.71 
 
 
503 aa  229  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  29.02 
 
 
511 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  31.01 
 
 
488 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3313  carbohydrate kinase, FGGY  30.86 
 
 
503 aa  228  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  29.02 
 
 
511 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  28.88 
 
 
517 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  28.88 
 
 
517 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  28.82 
 
 
511 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  29.48 
 
 
499 aa  223  6e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  28.63 
 
 
505 aa  223  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.43 
 
 
496 aa  223  9e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  30.1 
 
 
493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  29.59 
 
 
506 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  28.46 
 
 
518 aa  219  7.999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.68 
 
 
486 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.42 
 
 
509 aa  217  5e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>