More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4720 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  93.98 
 
 		 515 aa  938    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  75.88 
 
 		 513 aa  741    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  75.88 
 
 		 513 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  94.95 
 
 		 515 aa  952    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  76.65 
 
 		 514 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  75.88 
 
 		 513 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  93.98 
 
 		 515 aa  938    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  79.38 
 
 		 514 aa  848    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  75.88 
 
 		 513 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  98.06 
 
 		 515 aa  1020    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  67.64 
 
 		 508 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  77.54 
 
 		 514 aa  825    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  93.98 
 
 		 515 aa  938    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  100 
 
 		 515 aa  1040    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  89.9 
 
 		 520 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  75.88 
 
 		 513 aa  741    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  75.88 
 
 		 513 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  76.07 
 
 		 513 aa  742    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  59.42 
 
 		 512 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  50.49 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  45.88 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  46.37 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  46.67 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  45.97 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  37.14 
 
 		 509 aa  293  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  37.21 
 
 		 518 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  35.41 
 
 		 510 aa  289  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  37.94 
 
 		 548 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  33.65 
 
 		 500 aa  279  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  34.1 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  32.62 
 
 		 503 aa  278  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  33.46 
 
 		 502 aa  273  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  32.16 
 
 		 506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  37.04 
 
 		 498 aa  269  8e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  37.01 
 
 		 511 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  33.08 
 
 		 509 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  37.94 
 
 		 504 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  36.45 
 
 		 512 aa  264  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  34.97 
 
 		 495 aa  259  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  36.89 
 
 		 506 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.59 
 
 		 496 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  33.33 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  33.73 
 
 		 509 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  32.17 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  33.85 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  32.18 
 
 		 530 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  33.47 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.5 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  33 
 
 		 512 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  32.88 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  35.53 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.82 
 
 		 500 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  33.27 
 
 		 499 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  32.68 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  32.68 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  33.59 
 
 		 505 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  33 
 
 		 512 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  33 
 
 		 511 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  34.63 
 
 		 498 aa  237  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.46 
 
 		 515 aa  236  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  32.83 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  31.69 
 
 		 509 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  33.2 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  32.04 
 
 		 513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  32.04 
 
 		 513 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  31.04 
 
 		 489 aa  232  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  32.04 
 
 		 513 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  32.04 
 
 		 513 aa  230  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  31.83 
 
 		 513 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  32.04 
 
 		 513 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  32.04 
 
 		 513 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  32.6 
 
 		 512 aa  229  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  32.04 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  32.55 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.84 
 
 		 511 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  30.26 
 
 		 513 aa  227  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  30.69 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.21 
 
 		 492 aa  226  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.21 
 
 		 492 aa  226  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  33.59 
 
 		 524 aa  226  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  30.84 
 
 		 518 aa  225  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  36.72 
 
 		 499 aa  225  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  30.49 
 
 		 490 aa  224  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  33.6 
 
 		 519 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  36.15 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  32.09 
 
 		 489 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  30.49 
 
 		 503 aa  219  8.999999999999998e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.69 
 
 		 506 aa  217  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  29.45 
 
 		 517 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.89 
 
 		 512 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  29.45 
 
 		 517 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  31.91 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.02 
 
 		 517 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.56 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.76 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.02 
 
 		 517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  28.35 
 
 		 511 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  28.15 
 
 		 511 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  33.07 
 
 		 526 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  33.83 
 
 		 487 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>