More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3052 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  100 
 
 
511 aa  1012    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  57.23 
 
 
496 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  53.61 
 
 
518 aa  532  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  58.23 
 
 
498 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  58.25 
 
 
506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  53.21 
 
 
509 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  57.95 
 
 
504 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  51.7 
 
 
515 aa  498  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  51.81 
 
 
512 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  49.3 
 
 
511 aa  488  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  46.79 
 
 
500 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  49 
 
 
502 aa  487  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  47.9 
 
 
501 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  51.2 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  43.98 
 
 
509 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  41.08 
 
 
509 aa  412  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  47.9 
 
 
505 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  50.82 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  40.85 
 
 
489 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  41.13 
 
 
488 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  41.85 
 
 
499 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  40.12 
 
 
492 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  40.12 
 
 
492 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  37.38 
 
 
500 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  43.76 
 
 
511 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  43.25 
 
 
517 aa  362  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  43.25 
 
 
517 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  42.17 
 
 
484 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  46.12 
 
 
492 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  46.53 
 
 
492 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  46.53 
 
 
492 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  46.12 
 
 
492 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  42.17 
 
 
484 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  42.17 
 
 
484 aa  359  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  42.6 
 
 
485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  46.14 
 
 
492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  42.97 
 
 
484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  44.96 
 
 
484 aa  356  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  42.97 
 
 
484 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  42.83 
 
 
484 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  42.83 
 
 
484 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  42.83 
 
 
484 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  44.71 
 
 
485 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  44.69 
 
 
501 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  42.37 
 
 
484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  42.77 
 
 
484 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  41.57 
 
 
483 aa  353  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  44.78 
 
 
487 aa  352  8e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  42.77 
 
 
484 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  41.4 
 
 
484 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  49.34 
 
 
492 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  41.4 
 
 
484 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  42.17 
 
 
483 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  41.4 
 
 
484 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  41.4 
 
 
484 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  41.88 
 
 
486 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  41.16 
 
 
496 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  40.93 
 
 
493 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  41.53 
 
 
484 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  42.49 
 
 
486 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  37.55 
 
 
494 aa  343  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  39.88 
 
 
484 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  41.27 
 
 
493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  36.18 
 
 
503 aa  335  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  40 
 
 
493 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  37.88 
 
 
490 aa  333  3e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  39.44 
 
 
487 aa  333  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  40.35 
 
 
494 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  37.92 
 
 
492 aa  332  8e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  34.66 
 
 
496 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  41.95 
 
 
491 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  45.51 
 
 
478 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  41.16 
 
 
482 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  39.92 
 
 
493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  41.91 
 
 
493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  37.99 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  40.56 
 
 
493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  40.72 
 
 
495 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  41.91 
 
 
493 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  39.92 
 
 
493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  39.92 
 
 
493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  38.76 
 
 
486 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  37.68 
 
 
489 aa  326  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  41.4 
 
 
484 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  39.19 
 
 
483 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  38.99 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  39.84 
 
 
485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  42.03 
 
 
485 aa  319  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  45.08 
 
 
478 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  36.42 
 
 
484 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  38.08 
 
 
496 aa  316  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  44.64 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  41.28 
 
 
481 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  41.92 
 
 
490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  41.92 
 
 
490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  36.42 
 
 
484 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  41.7 
 
 
490 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  41.7 
 
 
490 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  42.14 
 
 
493 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  42.14 
 
 
493 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>