More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3125 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
498 aa  993    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  61.29 
 
 
498 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  59.43 
 
 
501 aa  547  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  53.28 
 
 
506 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  53.48 
 
 
489 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  51.5 
 
 
505 aa  473  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  52.11 
 
 
495 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  52.36 
 
 
493 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  51.59 
 
 
510 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  52.16 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  52.16 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  50.4 
 
 
505 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  45.81 
 
 
495 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3313  carbohydrate kinase, FGGY  41.39 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  37.65 
 
 
548 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  32.1 
 
 
512 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  33.4 
 
 
506 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  30.8 
 
 
511 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 
506 aa  253  7e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  30.23 
 
 
506 aa  252  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  34.98 
 
 
501 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  33.26 
 
 
512 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  35.56 
 
 
524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  35.02 
 
 
515 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  35.02 
 
 
515 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.93 
 
 
498 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  35.02 
 
 
515 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  34.94 
 
 
493 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  32.68 
 
 
538 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.05 
 
 
496 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.65 
 
 
509 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  33.27 
 
 
497 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  33.33 
 
 
515 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  30.14 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.16 
 
 
504 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.79 
 
 
511 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  36.52 
 
 
438 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  33.6 
 
 
512 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  32.76 
 
 
508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  34.82 
 
 
515 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  35.16 
 
 
506 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.92 
 
 
500 aa  217  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.57 
 
 
492 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.57 
 
 
492 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  32.19 
 
 
514 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  34.63 
 
 
515 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  32 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.23 
 
 
518 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.47 
 
 
515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.7 
 
 
501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.7 
 
 
496 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  33.91 
 
 
513 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  33.91 
 
 
513 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  33.91 
 
 
513 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.57 
 
 
497 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  33.91 
 
 
513 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  33.91 
 
 
513 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  33.91 
 
 
513 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.2 
 
 
512 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  34.17 
 
 
513 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  32.8 
 
 
502 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  30.86 
 
 
499 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  32.42 
 
 
505 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  32 
 
 
510 aa  206  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  33.78 
 
 
514 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  32.8 
 
 
520 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  33.6 
 
 
494 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  33.6 
 
 
494 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  33.6 
 
 
494 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.37 
 
 
509 aa  200  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  35.51 
 
 
481 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.13 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  32.72 
 
 
485 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.83 
 
 
503 aa  196  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.35 
 
 
499 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.83 
 
 
488 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.78 
 
 
509 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.96 
 
 
506 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  29.82 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  29.82 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  29.82 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  29.82 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  29.15 
 
 
514 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  29.82 
 
 
484 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  29.82 
 
 
484 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  29.86 
 
 
484 aa  190  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  30.69 
 
 
483 aa  189  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  33.06 
 
 
472 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.99 
 
 
511 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  29.61 
 
 
484 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.69 
 
 
483 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.69 
 
 
483 aa  187  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  29.61 
 
 
484 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.29 
 
 
500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  30.35 
 
 
519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  30.39 
 
 
438 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  33.2 
 
 
472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  30.73 
 
 
519 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.04 
 
 
502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.33 
 
 
490 aa  183  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>