More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2625 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  81.58 
 
 
493 aa  816    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
505 aa  1010    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  64.75 
 
 
494 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  64.75 
 
 
494 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  64.55 
 
 
494 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  51.29 
 
 
510 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  41.12 
 
 
501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.8 
 
 
500 aa  252  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  32.03 
 
 
505 aa  246  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  34.27 
 
 
495 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.69 
 
 
510 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.46 
 
 
509 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.12 
 
 
501 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  33.27 
 
 
495 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  34.22 
 
 
498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  32.88 
 
 
489 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  30.71 
 
 
512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.38 
 
 
488 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.37 
 
 
518 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.13 
 
 
509 aa  217  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.65 
 
 
502 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.18 
 
 
506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  29.96 
 
 
506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.57 
 
 
509 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  31.87 
 
 
548 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.06 
 
 
492 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.06 
 
 
492 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34 
 
 
501 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.13 
 
 
496 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.82 
 
 
506 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.65 
 
 
504 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.03 
 
 
515 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.41 
 
 
503 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  30.16 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  30.84 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.63 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.51 
 
 
500 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  32.61 
 
 
493 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  32.61 
 
 
493 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  32.61 
 
 
493 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  27.13 
 
 
511 aa  199  7.999999999999999e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.49 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.88 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.88 
 
 
512 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.63 
 
 
512 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.27 
 
 
511 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  32.42 
 
 
498 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.23 
 
 
499 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.14 
 
 
506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.43 
 
 
538 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  29.82 
 
 
506 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.68 
 
 
513 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.68 
 
 
513 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.07 
 
 
513 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  27.47 
 
 
513 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  27.47 
 
 
513 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  27.68 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  27.25 
 
 
513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.26 
 
 
513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.51 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  27.36 
 
 
512 aa  183  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.95 
 
 
499 aa  183  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  30.33 
 
 
514 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  26.95 
 
 
499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  26.46 
 
 
512 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  25.69 
 
 
503 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.16 
 
 
511 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.23 
 
 
498 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  25.68 
 
 
512 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.74 
 
 
496 aa  177  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.98 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  29.75 
 
 
505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  28.06 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  27.77 
 
 
487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  28.63 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.46 
 
 
530 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26 
 
 
512 aa  171  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  26.8 
 
 
518 aa  171  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.46 
 
 
512 aa  170  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.6 
 
 
506 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.48 
 
 
514 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.07 
 
 
512 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  30.27 
 
 
524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.07 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  31.85 
 
 
503 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  25.29 
 
 
512 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  25.88 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  28.43 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  29.92 
 
 
508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  28.54 
 
 
477 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.17 
 
 
508 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.01 
 
 
524 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  26.81 
 
 
492 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  31.53 
 
 
487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  28.43 
 
 
494 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  28.66 
 
 
526 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.02 
 
 
497 aa  162  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  25.97 
 
 
483 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  26.22 
 
 
509 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  27.29 
 
 
501 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>