More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0497 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  75.66 
 
 
491 aa  751    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  76.07 
 
 
490 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  76.28 
 
 
493 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  77.71 
 
 
493 aa  768    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  100 
 
 
494 aa  1002    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  76.28 
 
 
493 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  77.71 
 
 
493 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  77.71 
 
 
493 aa  772    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  76.28 
 
 
493 aa  751    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  85.71 
 
 
493 aa  863    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  85.1 
 
 
493 aa  842    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  77.51 
 
 
493 aa  766    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  76.28 
 
 
493 aa  732    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  77.3 
 
 
493 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  77.51 
 
 
493 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  77.51 
 
 
493 aa  766    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  75.87 
 
 
490 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  76.07 
 
 
490 aa  739    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  75.87 
 
 
490 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  62.47 
 
 
487 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  57.7 
 
 
496 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  54.84 
 
 
491 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  53.47 
 
 
486 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  54.49 
 
 
488 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  54.85 
 
 
486 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  50.82 
 
 
484 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  54.14 
 
 
492 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  54.14 
 
 
492 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  51.02 
 
 
484 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  49.19 
 
 
494 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  53.47 
 
 
484 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  53.47 
 
 
484 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  53.47 
 
 
484 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  53.47 
 
 
484 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  53.27 
 
 
484 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  50.82 
 
 
484 aa  477  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  54.3 
 
 
485 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  53.67 
 
 
484 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  53.47 
 
 
484 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  54.36 
 
 
492 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  53.94 
 
 
492 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  52.35 
 
 
483 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  53.96 
 
 
492 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  53.56 
 
 
484 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  56.43 
 
 
488 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  54.99 
 
 
486 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  54.49 
 
 
481 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  56.43 
 
 
488 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  53.47 
 
 
484 aa  475  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  53.47 
 
 
484 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  52.35 
 
 
484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  53.28 
 
 
482 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  52.7 
 
 
483 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  52.15 
 
 
484 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  53.64 
 
 
492 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  48.78 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  53.28 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  53.36 
 
 
483 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  55.48 
 
 
486 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  51.94 
 
 
484 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  50.93 
 
 
484 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  47.12 
 
 
486 aa  463  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  54.88 
 
 
488 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  49.69 
 
 
489 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  53.09 
 
 
526 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  52.49 
 
 
483 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  49.38 
 
 
484 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  52.58 
 
 
475 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  55.48 
 
 
486 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  52.58 
 
 
475 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  49.79 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  52.58 
 
 
475 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  52.58 
 
 
475 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  55.69 
 
 
488 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  55.69 
 
 
486 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  53.51 
 
 
485 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  52.07 
 
 
485 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  55.24 
 
 
486 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  51.13 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  52.45 
 
 
485 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  53.72 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  49.59 
 
 
496 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  52.08 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  49.9 
 
 
484 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  50.21 
 
 
478 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  50.21 
 
 
478 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  48.44 
 
 
481 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  48.81 
 
 
508 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  45.55 
 
 
495 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  50 
 
 
480 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  48.56 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  44.33 
 
 
492 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  40.04 
 
 
500 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  40.08 
 
 
518 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  46.15 
 
 
533 aa  355  8.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  37.07 
 
 
492 aa  349  7e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  37.07 
 
 
492 aa  349  7e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  43.78 
 
 
498 aa  342  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  42.42 
 
 
496 aa  341  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  37.88 
 
 
489 aa  339  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>