More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0177 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  100 
 
 
492 aa  992    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  45.31 
 
 
493 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  44.9 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  45.7 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  45.7 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  44.33 
 
 
494 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  45.49 
 
 
493 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  45.29 
 
 
493 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  45.29 
 
 
493 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  44.88 
 
 
493 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  44.47 
 
 
483 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  46.42 
 
 
490 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  44.88 
 
 
493 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  44.47 
 
 
483 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  46.42 
 
 
490 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  46.01 
 
 
493 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  46.22 
 
 
490 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  46.22 
 
 
490 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  42.53 
 
 
484 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  46.01 
 
 
493 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  46.01 
 
 
493 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  44.67 
 
 
491 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  45.08 
 
 
493 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  43.57 
 
 
486 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  45.62 
 
 
485 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  43.01 
 
 
485 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  41.91 
 
 
484 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  45.8 
 
 
481 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  45.27 
 
 
496 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  41.7 
 
 
484 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  44.56 
 
 
486 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  40.16 
 
 
494 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  44.06 
 
 
484 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  44.79 
 
 
484 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  44.44 
 
 
481 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  43.62 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  43.62 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  43.3 
 
 
488 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  42.89 
 
 
484 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  43.83 
 
 
484 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  44.15 
 
 
484 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  43.42 
 
 
484 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  42.89 
 
 
484 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  43.62 
 
 
484 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  43.62 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  43.62 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  42.68 
 
 
484 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  42.27 
 
 
487 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  42.47 
 
 
484 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  42.39 
 
 
486 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  42.08 
 
 
484 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  42.15 
 
 
484 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  44.08 
 
 
486 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  42.29 
 
 
478 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  42.06 
 
 
483 aa  362  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  40.42 
 
 
489 aa  360  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  41.89 
 
 
484 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  44.92 
 
 
492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  41.89 
 
 
484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  44.62 
 
 
492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  44.62 
 
 
492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  44.69 
 
 
492 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  44.72 
 
 
492 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  44.42 
 
 
492 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  44.59 
 
 
488 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  41.46 
 
 
496 aa  355  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  41.27 
 
 
495 aa  353  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  44.28 
 
 
479 aa  352  8e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  39.45 
 
 
500 aa  352  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  44.16 
 
 
488 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  44.16 
 
 
488 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  43.06 
 
 
485 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  41.91 
 
 
478 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  42.12 
 
 
478 aa  349  8e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  39.88 
 
 
492 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  42.39 
 
 
491 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  37.4 
 
 
492 aa  343  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  37.4 
 
 
492 aa  343  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  43.94 
 
 
488 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  40.92 
 
 
508 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  40.62 
 
 
492 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  40.9 
 
 
483 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  42.46 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  42.46 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  42.64 
 
 
486 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  42.24 
 
 
475 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  42.24 
 
 
475 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  42.24 
 
 
475 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  42.24 
 
 
475 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  40.87 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  41.74 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  42.24 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  42.09 
 
 
485 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  38.1 
 
 
489 aa  329  8e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  40.97 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  42.08 
 
 
485 aa  326  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  40 
 
 
483 aa  325  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  41.72 
 
 
526 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  38.03 
 
 
488 aa  323  6e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  44.91 
 
 
533 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>