More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1510 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
524 aa  1050    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  46.09 
 
 
497 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  43.4 
 
 
502 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  44.17 
 
 
482 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  42.79 
 
 
438 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  36.91 
 
 
501 aa  295  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.65 
 
 
509 aa  269  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.41 
 
 
503 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.89 
 
 
510 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  35.21 
 
 
498 aa  257  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  32.76 
 
 
545 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  32.76 
 
 
545 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.34 
 
 
518 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.13 
 
 
512 aa  251  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  32.57 
 
 
545 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  29.57 
 
 
538 aa  248  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.38 
 
 
500 aa  246  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  31.43 
 
 
542 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  31.43 
 
 
526 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  33.01 
 
 
528 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.94 
 
 
509 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  27.35 
 
 
506 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  31.8 
 
 
545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.32 
 
 
530 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.38 
 
 
501 aa  239  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  33.65 
 
 
525 aa  238  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  30.02 
 
 
514 aa  236  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  33.14 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  35.56 
 
 
498 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.05 
 
 
509 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  32.43 
 
 
548 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  31 
 
 
556 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.45 
 
 
499 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  31.24 
 
 
505 aa  229  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  30.92 
 
 
512 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.74 
 
 
504 aa  226  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.21 
 
 
502 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.14 
 
 
496 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  34.93 
 
 
543 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  27.69 
 
 
506 aa  223  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.18 
 
 
499 aa  223  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  33.4 
 
 
547 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  33.66 
 
 
526 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  30.4 
 
 
509 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  29.01 
 
 
506 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  31.67 
 
 
511 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.09 
 
 
506 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.39 
 
 
515 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.71 
 
 
501 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.92 
 
 
511 aa  217  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  33.4 
 
 
498 aa  216  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  31.42 
 
 
564 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  32.49 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  30.26 
 
 
489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  32.55 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  32.55 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  32.55 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  33.9 
 
 
547 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  34.05 
 
 
544 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.04 
 
 
496 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  30.54 
 
 
564 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.99 
 
 
511 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.95 
 
 
497 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  34.85 
 
 
564 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  31.46 
 
 
543 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.39 
 
 
506 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  28.93 
 
 
506 aa  208  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  32.94 
 
 
540 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  29.03 
 
 
519 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.89 
 
 
486 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  32.39 
 
 
554 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  33.53 
 
 
544 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  32.23 
 
 
501 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  31.83 
 
 
538 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  32.14 
 
 
577 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  32.02 
 
 
585 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  30.97 
 
 
527 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  30.07 
 
 
495 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  32.61 
 
 
481 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  31.94 
 
 
528 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  33.4 
 
 
506 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  32.13 
 
 
545 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.63 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  33.02 
 
 
598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  34.34 
 
 
572 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  31.64 
 
 
508 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  27.94 
 
 
512 aa  199  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  30.16 
 
 
523 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  32.26 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  29.55 
 
 
562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  34.03 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28.49 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  34.48 
 
 
551 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  31.16 
 
 
527 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  31.64 
 
 
534 aa  197  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  29.22 
 
 
520 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  28.52 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  31.64 
 
 
534 aa  196  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  26.69 
 
 
519 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.87 
 
 
505 aa  195  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>