More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2713 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  100 
 
 		 485 aa  962    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  59.62 
 
 		 481 aa  522  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  55.42 
 
 		 483 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  55.21 
 
 		 483 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  54.64 
 
 		 484 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  54.58 
 
 		 485 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  55.35 
 
 		 481 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  54.05 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  54.05 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  53.32 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  54.32 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  54.32 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  55.95 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  53.91 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  55.95 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  55.95 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  54.6 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  55.95 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  55.95 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  55.74 
 
 		 490 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  53.51 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  54.49 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  53.59 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  55.42 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  55.74 
 
 		 490 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  54.34 
 
 		 484 aa  471  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  54.12 
 
 		 493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  54.58 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  53.91 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  53.25 
 
 		 493 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  54.1 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  53.53 
 
 		 486 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  53.94 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  57.61 
 
 		 486 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  52.16 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  53.72 
 
 		 478 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  56.96 
 
 		 486 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  55.72 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  56.74 
 
 		 486 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  55.72 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  55.72 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  55.72 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  56.74 
 
 		 486 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  49.17 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  50.52 
 
 		 482 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  55.39 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  55.39 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  53.93 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  52.56 
 
 		 491 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  52.69 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  50.73 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  45.88 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  54.96 
 
 		 488 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  49.19 
 
 		 492 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  49.18 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  56.12 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  56.11 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  52.27 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  50.62 
 
 		 486 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  49.32 
 
 		 526 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  51.85 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  51.65 
 
 		 492 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  51.33 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  52.39 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  50.41 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  51.33 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  48.55 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  46.72 
 
 		 495 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  52.05 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  48.55 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  48.34 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  50.72 
 
 		 492 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  48.34 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  50.1 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  46.27 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  50.72 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  47.25 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  47.84 
 
 		 484 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  47.84 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  48.04 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  47.84 
 
 		 484 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  47.3 
 
 		 484 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  47.1 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  47.84 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  47.84 
 
 		 484 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  47.3 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  47.63 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  47.94 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  47.1 
 
 		 484 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  47.51 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  47.68 
 
 		 508 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  45.62 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  39.6 
 
 		 500 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  46.97 
 
 		 533 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  38.55 
 
 		 518 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  42.48 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  35.38 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  35.38 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  41 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  43.27 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>