More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5794 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  80.41 
 
 
475 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  80.41 
 
 
475 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  82.47 
 
 
486 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  95.7 
 
 
488 aa  840    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  98.77 
 
 
488 aa  959    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  82.68 
 
 
486 aa  741    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  67.7 
 
 
486 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  82.27 
 
 
486 aa  737    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  100 
 
 
488 aa  975    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  82.47 
 
 
486 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  72.99 
 
 
488 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  100 
 
 
488 aa  975    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  80.41 
 
 
475 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  80.41 
 
 
475 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  56.7 
 
 
491 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  55.67 
 
 
493 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  55.46 
 
 
493 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  56.43 
 
 
493 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  56.29 
 
 
493 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  54.71 
 
 
494 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  56.29 
 
 
493 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  56.49 
 
 
490 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  56.38 
 
 
493 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  56.29 
 
 
490 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  55.6 
 
 
493 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  56.29 
 
 
490 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  56.49 
 
 
490 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  54.73 
 
 
493 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  56.7 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  56.7 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  56.7 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  56.22 
 
 
493 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  54.32 
 
 
493 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  55.12 
 
 
496 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  53.06 
 
 
491 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  52.28 
 
 
484 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  52.07 
 
 
484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  51.87 
 
 
484 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  52.08 
 
 
485 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  51.14 
 
 
483 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  49.9 
 
 
487 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  51.35 
 
 
483 aa  465  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  50.21 
 
 
484 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  50.21 
 
 
484 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  52.49 
 
 
484 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  50.21 
 
 
484 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  50.21 
 
 
484 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  54.34 
 
 
485 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  52.73 
 
 
481 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  50.21 
 
 
484 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  50 
 
 
484 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  50 
 
 
484 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  52.9 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  51.77 
 
 
483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  50.21 
 
 
484 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  50.1 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  50.1 
 
 
489 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  51.55 
 
 
485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  48.55 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  48.66 
 
 
484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  48.55 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  50.72 
 
 
486 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  48.55 
 
 
484 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  51.55 
 
 
486 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  48.44 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  47.61 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  52.08 
 
 
478 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  49.8 
 
 
508 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  48.86 
 
 
484 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  52.85 
 
 
485 aa  438  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  45.1 
 
 
494 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  48.65 
 
 
484 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  50.58 
 
 
526 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  48.44 
 
 
484 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  52.39 
 
 
479 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  49.69 
 
 
481 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  50.82 
 
 
492 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  52.26 
 
 
485 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  46.89 
 
 
482 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  51.15 
 
 
478 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  50.4 
 
 
492 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  50.94 
 
 
478 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  50.31 
 
 
492 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  50.61 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  45.93 
 
 
492 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  50.61 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  50.92 
 
 
492 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  50.73 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  46.04 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  43.51 
 
 
496 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  43.65 
 
 
492 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  42.71 
 
 
495 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  38.18 
 
 
500 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  37.07 
 
 
518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  43.84 
 
 
499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  36.89 
 
 
489 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  40.21 
 
 
496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  41.56 
 
 
498 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  35.66 
 
 
501 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  42.16 
 
 
504 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>