More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4156 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  74.85 
 
 		 484 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  74.64 
 
 		 484 aa  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  78.35 
 
 		 486 aa  760    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  74.85 
 
 		 484 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  76.86 
 
 		 484 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  76.86 
 
 		 484 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  73.2 
 
 		 484 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  74.64 
 
 		 484 aa  717    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  81.44 
 
 		 486 aa  756    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  100 
 
 		 485 aa  991    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  74.85 
 
 		 484 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  72.99 
 
 		 484 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  74.85 
 
 		 484 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  74.43 
 
 		 484 aa  716    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  73.2 
 
 		 484 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  72.99 
 
 		 484 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  73.2 
 
 		 484 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  74.85 
 
 		 484 aa  719    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  76.86 
 
 		 484 aa  751    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  76.08 
 
 		 483 aa  710    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  94.64 
 
 		 485 aa  883    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  63.02 
 
 		 486 aa  626  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  64.74 
 
 		 483 aa  624  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  61.11 
 
 		 492 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  62.53 
 
 		 492 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  62.53 
 
 		 492 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  62.53 
 
 		 492 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  62.73 
 
 		 492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  61.71 
 
 		 492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  61.71 
 
 		 492 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  60.21 
 
 		 482 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  52.98 
 
 		 494 aa  511  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  54.51 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  53.48 
 
 		 493 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  53.99 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  53.99 
 
 		 493 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  53.39 
 
 		 493 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  53.17 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  53.37 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  53.39 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  53.37 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  54.19 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  52.66 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  55.46 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  53.58 
 
 		 493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  53.17 
 
 		 490 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  52.97 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  53.37 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  52.97 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  53.37 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  52.55 
 
 		 491 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  53.37 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  53.17 
 
 		 490 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  49.59 
 
 		 495 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  52.38 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  50.61 
 
 		 489 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  55.42 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  50.31 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  51.59 
 
 		 508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  49.28 
 
 		 484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  54.42 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  54.87 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  54.87 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  54.42 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  54.42 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  54.42 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  47.95 
 
 		 487 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  53.7 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  54.63 
 
 		 486 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  48.88 
 
 		 484 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  53.7 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  53.22 
 
 		 488 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  54.39 
 
 		 486 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  49.69 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  50.41 
 
 		 484 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  51.14 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  48.06 
 
 		 483 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  52.51 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  49.08 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  52.69 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  51.95 
 
 		 478 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  48.26 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  51.13 
 
 		 485 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  50 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  49.07 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  49.59 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  49.69 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  51.33 
 
 		 526 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  44.42 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  48.14 
 
 		 484 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  44.16 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  45.49 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  40.12 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  38.56 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  43.57 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  38.11 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  43.53 
 
 		 492 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  45.86 
 
 		 499 aa  355  8.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  43.45 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  42.66 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>