More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3895 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
524 aa  1019    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  65.87 
 
 
526 aa  606  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  62.3 
 
 
501 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  43.69 
 
 
513 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  43.34 
 
 
513 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  43.14 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  43.14 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  43.23 
 
 
513 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  43.14 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  43.43 
 
 
512 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  43.14 
 
 
513 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  48.4 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  43.29 
 
 
513 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  41.47 
 
 
506 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  44.93 
 
 
514 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  41.95 
 
 
512 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  41.92 
 
 
511 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  46.02 
 
 
530 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  41.72 
 
 
511 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  41.72 
 
 
511 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  40 
 
 
513 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  41.32 
 
 
511 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  39.8 
 
 
517 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  39.8 
 
 
517 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  41.63 
 
 
518 aa  414  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  52.88 
 
 
530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  41.28 
 
 
512 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  40.88 
 
 
512 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  40.24 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  40.68 
 
 
512 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  40.68 
 
 
511 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  40.48 
 
 
512 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  39.84 
 
 
509 aa  388  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  38.45 
 
 
509 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  39.71 
 
 
489 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  37.68 
 
 
499 aa  371  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  51.04 
 
 
513 aa  368  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  39.71 
 
 
486 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  48.55 
 
 
476 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  33.13 
 
 
502 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40.79 
 
 
495 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  34.89 
 
 
476 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  34.89 
 
 
476 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  38.42 
 
 
509 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.31 
 
 
500 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  42.72 
 
 
333 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  34.74 
 
 
496 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.72 
 
 
501 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.81 
 
 
518 aa  249  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  37.5 
 
 
487 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  36.14 
 
 
498 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.18 
 
 
509 aa  239  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.18 
 
 
512 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  32.47 
 
 
499 aa  237  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.69 
 
 
500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  34.33 
 
 
511 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.27 
 
 
538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  34.52 
 
 
515 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  37.07 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  30.4 
 
 
502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  34.12 
 
 
517 aa  233  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  34.12 
 
 
517 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  34.8 
 
 
511 aa  232  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  32.28 
 
 
511 aa  230  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.83 
 
 
489 aa  230  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.02 
 
 
509 aa  229  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  34.62 
 
 
506 aa  226  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  37.47 
 
 
483 aa  226  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  34 
 
 
506 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.17 
 
 
503 aa  224  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.63 
 
 
492 aa  224  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.63 
 
 
492 aa  224  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  25.8 
 
 
505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  34.69 
 
 
504 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.84 
 
 
505 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.95 
 
 
499 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.28 
 
 
496 aa  220  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  33.85 
 
 
514 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  36.65 
 
 
499 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  30.26 
 
 
496 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.53 
 
 
511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  31.38 
 
 
488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  32.41 
 
 
512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.87 
 
 
497 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  32.32 
 
 
514 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  35.16 
 
 
501 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  29.12 
 
 
503 aa  209  9e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  27.56 
 
 
506 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.81 
 
 
499 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  28.69 
 
 
506 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  32.16 
 
 
510 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  33 
 
 
484 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  33.93 
 
 
515 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  33.93 
 
 
515 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  33.93 
 
 
515 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  34.11 
 
 
515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  35.03 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  35.45 
 
 
520 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  33.53 
 
 
508 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  29.19 
 
 
512 aa  200  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>