More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0861 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  71.94 
 
 		 509 aa  796    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 509 aa  1056    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  49.8 
 
 		 518 aa  533  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  49.12 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  43.59 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  43.79 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  43.79 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  44.18 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  43.59 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  43.79 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  43.79 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  43.79 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  43.79 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  43.59 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  44.47 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  41.68 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  42.47 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  42.47 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  44.16 
 
 		 519 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  42.75 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  42.35 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  42.35 
 
 		 511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  42.55 
 
 		 511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  39.33 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  39.21 
 
 		 530 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  40.36 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  39.68 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  40.4 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  40 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  39.09 
 
 		 511 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  39.09 
 
 		 512 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  36.76 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  38.45 
 
 		 524 aa  359  7e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  37.13 
 
 		 501 aa  349  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  36.31 
 
 		 526 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  37.75 
 
 		 495 aa  340  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  35.15 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  36.2 
 
 		 486 aa  332  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  36.35 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  42.9 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  32.79 
 
 		 513 aa  286  7e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  32.79 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  32.79 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  34.18 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  33.56 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  28.83 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.89 
 
 		 503 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.71 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.67 
 
 		 502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.92 
 
 		 500 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.29 
 
 		 483 aa  216  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.77 
 
 		 501 aa  216  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.6 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.6 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.12 
 
 		 509 aa  212  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.88 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  28.06 
 
 		 496 aa  207  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.69 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  28.49 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.92 
 
 		 497 aa  202  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.66 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.02 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.89 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.38 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.55 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.76 
 
 		 512 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.85 
 
 		 506 aa  196  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  30.65 
 
 		 514 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  26.92 
 
 		 509 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  30.54 
 
 		 515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  30.54 
 
 		 515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  30.54 
 
 		 515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.64 
 
 		 496 aa  189  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.7 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  24.35 
 
 		 538 aa  188  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25.05 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  26.23 
 
 		 515 aa  187  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  31.61 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.81 
 
 		 499 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  28.97 
 
 		 499 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  29.64 
 
 		 517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  31.46 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  29.41 
 
 		 517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.79 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.35 
 
 		 489 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  31.69 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.21 
 
 		 500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  30.05 
 
 		 511 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  25.96 
 
 		 498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  26.22 
 
 		 511 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.85 
 
 		 512 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  28.46 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.22 
 
 		 509 aa  181  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  25.3 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.55 
 
 		 504 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0150  gluconate kinase  28.54 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.731797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  25.93 
 
 		 494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  25.71 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  28.23 
 
 		 484 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>