More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3232 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  61.33 
 
 		 512 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  75.29 
 
 		 513 aa  765    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  75.29 
 
 		 513 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  79.38 
 
 		 515 aa  818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  78.75 
 
 		 515 aa  824    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  100 
 
 		 514 aa  1055    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  75.88 
 
 		 514 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  79.57 
 
 		 515 aa  834    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  79.57 
 
 		 515 aa  834    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  78.56 
 
 		 520 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  78.79 
 
 		 515 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  79.57 
 
 		 515 aa  834    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  67.25 
 
 		 508 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  75.29 
 
 		 513 aa  765    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  75.29 
 
 		 513 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  84.96 
 
 		 514 aa  903    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  75.29 
 
 		 513 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  75.49 
 
 		 513 aa  767    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  75.29 
 
 		 513 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  49.32 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  46.95 
 
 		 506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  46.17 
 
 		 506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  46.95 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  46.56 
 
 		 512 aa  498  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.94 
 
 		 509 aa  302  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  37.12 
 
 		 518 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  37.96 
 
 		 548 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  32.75 
 
 		 503 aa  289  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  33.53 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  32.24 
 
 		 510 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  34.9 
 
 		 502 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  34.85 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.49 
 
 		 501 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.97 
 
 		 512 aa  267  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.95 
 
 		 509 aa  266  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  31.4 
 
 		 505 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.23 
 
 		 504 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.98 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  33.07 
 
 		 530 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.08 
 
 		 498 aa  259  9e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.98 
 
 		 499 aa  256  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  33.4 
 
 		 498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  32.81 
 
 		 512 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.79 
 
 		 506 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  32.95 
 
 		 493 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  30.62 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  34.45 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  32.95 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  32.95 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  32.82 
 
 		 495 aa  251  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.4 
 
 		 496 aa  250  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  32.05 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  36.13 
 
 		 499 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.33 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  32.41 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  34.32 
 
 		 515 aa  243  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  32.41 
 
 		 511 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  32.41 
 
 		 512 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  32.08 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  32.08 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  30.64 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.77 
 
 		 492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.77 
 
 		 492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  32.08 
 
 		 513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  32.08 
 
 		 513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  31.88 
 
 		 513 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  31.68 
 
 		 513 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  32.3 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  32.08 
 
 		 513 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.55 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  31.68 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  29.28 
 
 		 513 aa  238  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  32.28 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  30.71 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  31.81 
 
 		 512 aa  236  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  31.49 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  30.34 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  31.21 
 
 		 505 aa  233  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  31.91 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  30.49 
 
 		 490 aa  229  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  30.44 
 
 		 503 aa  229  9e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  31.59 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  33.4 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  32.81 
 
 		 524 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  30.72 
 
 		 489 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  34.13 
 
 		 499 aa  226  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  29.84 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  29.84 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  34.83 
 
 		 505 aa  223  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  32.19 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.43 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  33.05 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  32.16 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  30.81 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  27.04 
 
 		 511 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  27.04 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  26.85 
 
 		 511 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  28.49 
 
 		 509 aa  213  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  30.58 
 
 		 517 aa  210  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  26.46 
 
 		 511 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>