More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 
526 aa  1041    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  65.87 
 
 
524 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  59.04 
 
 
501 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  43.63 
 
 
513 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  43.63 
 
 
513 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  43.63 
 
 
513 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  43.63 
 
 
513 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  43.63 
 
 
513 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  43.63 
 
 
513 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  42.08 
 
 
506 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  47.25 
 
 
519 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  43.43 
 
 
513 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  43.68 
 
 
513 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  43.68 
 
 
512 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  42.63 
 
 
512 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  44.31 
 
 
514 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  41.24 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  43.85 
 
 
530 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  41.73 
 
 
511 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  41.53 
 
 
511 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  40.91 
 
 
518 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  41.53 
 
 
511 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  49.04 
 
 
530 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  41.26 
 
 
511 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  40.4 
 
 
499 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  41.2 
 
 
512 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  40.6 
 
 
511 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  40.4 
 
 
512 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  40.6 
 
 
512 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  40.4 
 
 
512 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  39.17 
 
 
509 aa  386  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  38.11 
 
 
513 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  36.71 
 
 
509 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  36.56 
 
 
517 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  36.56 
 
 
517 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  46.94 
 
 
476 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  37.65 
 
 
489 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  38.1 
 
 
486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  44.16 
 
 
513 aa  349  9e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40.83 
 
 
495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  33.47 
 
 
502 aa  330  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  34.08 
 
 
476 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  34.08 
 
 
476 aa  295  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.97 
 
 
509 aa  276  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.98 
 
 
500 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  37.92 
 
 
498 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  34.33 
 
 
496 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  34.26 
 
 
499 aa  257  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.46 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.75 
 
 
518 aa  253  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.86 
 
 
512 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.87 
 
 
502 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.93 
 
 
483 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  42.14 
 
 
333 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  36.29 
 
 
499 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.97 
 
 
509 aa  239  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.39 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  27.61 
 
 
505 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.02 
 
 
504 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.76 
 
 
511 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  31.62 
 
 
496 aa  229  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.68 
 
 
511 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.8 
 
 
511 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.74 
 
 
505 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.49 
 
 
517 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.49 
 
 
517 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.73 
 
 
506 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.02 
 
 
503 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.06 
 
 
499 aa  223  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.07 
 
 
515 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.63 
 
 
500 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  28.43 
 
 
506 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  34.65 
 
 
487 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  29.77 
 
 
519 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.73 
 
 
484 aa  216  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  34.48 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.63 
 
 
492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.63 
 
 
492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.34 
 
 
496 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  30.63 
 
 
538 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  31.38 
 
 
506 aa  213  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  32.33 
 
 
501 aa  213  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  31.96 
 
 
514 aa  212  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  32.04 
 
 
514 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  33.88 
 
 
481 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.05 
 
 
497 aa  207  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  29.18 
 
 
506 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  32.05 
 
 
548 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.6 
 
 
503 aa  203  6e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  32.36 
 
 
510 aa  203  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  31.24 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.37 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.96 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.33 
 
 
511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.56 
 
 
505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  32.49 
 
 
508 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  30.53 
 
 
464 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.85 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  29.29 
 
 
510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  29.38 
 
 
506 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>