More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0131 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  100 
 
 		 503 aa  1038    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  49.8 
 
 		 500 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  51.52 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  46.06 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  43.92 
 
 		 501 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  44.83 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  41.58 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  40 
 
 		 518 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  41.96 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  41.22 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  40.12 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  40.28 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  42.31 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  40.68 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  40.28 
 
 		 506 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  39.76 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  38.87 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  40.46 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  38.35 
 
 		 498 aa  360  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  39.11 
 
 		 499 aa  355  7.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  41.04 
 
 		 488 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  38.74 
 
 		 511 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  38.67 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  38.48 
 
 		 517 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  37.32 
 
 		 505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  36.18 
 
 		 511 aa  336  5.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  35.66 
 
 		 492 aa  329  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  35.66 
 
 		 492 aa  329  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  37.9 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  36.89 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  38.59 
 
 		 492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  38.1 
 
 		 495 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  35.77 
 
 		 487 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  38.75 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  36.62 
 
 		 499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  35.25 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  38.51 
 
 		 501 aa  304  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  41.71 
 
 		 484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  37.53 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  37.4 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  39.95 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  39.5 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  37.63 
 
 		 484 aa  299  9e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  37.63 
 
 		 484 aa  299  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  37.63 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  37.63 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  37.63 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  37.63 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  36.98 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  37.63 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  36.98 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  41.36 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  41.88 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  39.27 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  38.29 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  39.27 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  38.91 
 
 		 484 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  36.25 
 
 		 484 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  37.44 
 
 		 483 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  37.01 
 
 		 484 aa  293  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  38.38 
 
 		 482 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  40.68 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.2 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  38.72 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  40.09 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  37.65 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.48 
 
 		 493 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  39.05 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  36.44 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  34.65 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  36.73 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  36.8 
 
 		 484 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  35.92 
 
 		 485 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.2 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  36.8 
 
 		 484 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  35.2 
 
 		 493 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  35.2 
 
 		 493 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.74 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  36.59 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.05 
 
 		 493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  35.26 
 
 		 493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  38 
 
 		 496 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  38.06 
 
 		 478 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  38.06 
 
 		 478 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  35.05 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  37.27 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  38.29 
 
 		 480 aa  281  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  35.97 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  37.2 
 
 		 488 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  37.2 
 
 		 488 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  37.35 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  32.8 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  37.35 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  36.01 
 
 		 481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  38.91 
 
 		 492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  38.24 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  36.85 
 
 		 484 aa  274  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  34.28 
 
 		 493 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  36.96 
 
 		 488 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  38.24 
 
 		 492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>