More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0411 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  100 
 
 
496 aa  1013    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  67.07 
 
 
498 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  59.88 
 
 
504 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  59.84 
 
 
506 aa  578  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  55.93 
 
 
518 aa  568  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  52.31 
 
 
500 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  57.23 
 
 
511 aa  543  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  53.41 
 
 
502 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  52.27 
 
 
509 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  51.81 
 
 
515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  51.31 
 
 
512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  50.88 
 
 
511 aa  518  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  50.3 
 
 
501 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  49.31 
 
 
509 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  52.55 
 
 
499 aa  491  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  45.71 
 
 
489 aa  472  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  45.27 
 
 
499 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  47.98 
 
 
505 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  42.05 
 
 
500 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  42.83 
 
 
509 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  48.35 
 
 
499 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  40.95 
 
 
496 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  41.02 
 
 
492 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  41.02 
 
 
492 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  42.42 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  40.57 
 
 
488 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  45.17 
 
 
487 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  43.12 
 
 
496 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  42.31 
 
 
503 aa  384  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  40.97 
 
 
511 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  40.31 
 
 
517 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  40.31 
 
 
517 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  43.31 
 
 
484 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  43.72 
 
 
484 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  43.1 
 
 
484 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  43 
 
 
501 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  41.49 
 
 
486 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  41.98 
 
 
483 aa  379  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  43.1 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  43.1 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  42.89 
 
 
484 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  43.1 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  43.1 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  43.1 
 
 
484 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  43.45 
 
 
493 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  43.3 
 
 
484 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  42.26 
 
 
484 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  42.26 
 
 
484 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  39.8 
 
 
494 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  40.52 
 
 
492 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  42.2 
 
 
493 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  42.77 
 
 
495 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  42.26 
 
 
484 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  43.3 
 
 
484 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  42.42 
 
 
494 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  43.3 
 
 
484 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  43.36 
 
 
485 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  42.05 
 
 
484 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  42.36 
 
 
483 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  41.79 
 
 
493 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  40.5 
 
 
484 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  42.98 
 
 
486 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  41.37 
 
 
493 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  40.82 
 
 
486 aa  362  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  41.58 
 
 
493 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  42.44 
 
 
485 aa  362  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  42.83 
 
 
493 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  44.22 
 
 
491 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  41.58 
 
 
493 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  41.79 
 
 
493 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  41.79 
 
 
493 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  40.41 
 
 
484 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  41.77 
 
 
482 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  42.51 
 
 
492 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  41.54 
 
 
490 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  41.54 
 
 
490 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  41.54 
 
 
490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  41.54 
 
 
490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  40.58 
 
 
487 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  39.84 
 
 
489 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  42.89 
 
 
492 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  41.44 
 
 
486 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  41.98 
 
 
508 aa  348  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  41.9 
 
 
492 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  39.03 
 
 
485 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  42.11 
 
 
492 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  42.11 
 
 
492 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  41.29 
 
 
493 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  41.29 
 
 
493 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  41.29 
 
 
493 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  39.35 
 
 
483 aa  345  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  40.12 
 
 
491 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  39.35 
 
 
483 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  38.11 
 
 
488 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  40.12 
 
 
493 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  41.9 
 
 
492 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  41.77 
 
 
486 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  41.77 
 
 
486 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  40.37 
 
 
481 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  40.53 
 
 
484 aa  335  9e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>