More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19510 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  100 
 
 
501 aa  1026    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  53.07 
 
 
518 aa  539  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  51.49 
 
 
515 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  49.61 
 
 
509 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  50.3 
 
 
496 aa  491  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  48.43 
 
 
509 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  49 
 
 
502 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  48.19 
 
 
500 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  48.62 
 
 
511 aa  479  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  46.29 
 
 
500 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  50 
 
 
498 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  46.57 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  47.5 
 
 
506 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  47.4 
 
 
504 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  45.36 
 
 
492 aa  463  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  45.36 
 
 
492 aa  463  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  47.42 
 
 
512 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  47.9 
 
 
511 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  45.02 
 
 
490 aa  424  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  44.58 
 
 
499 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  42.24 
 
 
509 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  42.3 
 
 
496 aa  415  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  43.92 
 
 
503 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  41.21 
 
 
489 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  42.22 
 
 
505 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  38.61 
 
 
517 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  38.42 
 
 
517 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  40.89 
 
 
488 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  38.55 
 
 
511 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  40.33 
 
 
484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  38.62 
 
 
484 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  39.51 
 
 
484 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  39.3 
 
 
484 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  39.3 
 
 
484 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  39.3 
 
 
484 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  39.51 
 
 
484 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  39.3 
 
 
484 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  39.75 
 
 
484 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  39.09 
 
 
484 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  39.09 
 
 
484 aa  347  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  37.86 
 
 
484 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  37.86 
 
 
484 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  37.86 
 
 
484 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  41.41 
 
 
499 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  37.86 
 
 
484 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  37.02 
 
 
496 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  38.87 
 
 
485 aa  343  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  39.96 
 
 
492 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  39.96 
 
 
492 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  39.96 
 
 
492 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  38.11 
 
 
485 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  38.48 
 
 
486 aa  339  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  39.31 
 
 
483 aa  339  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  35.92 
 
 
481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  38.09 
 
 
493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  37.7 
 
 
485 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  38.27 
 
 
483 aa  336  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  37.17 
 
 
486 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  37.76 
 
 
489 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  35.96 
 
 
494 aa  333  4e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  36.97 
 
 
496 aa  332  8e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  36.9 
 
 
486 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  39.2 
 
 
492 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  37.04 
 
 
484 aa  329  9e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.56 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  39.16 
 
 
482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  36.59 
 
 
472 aa  326  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  37.53 
 
 
493 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  39.16 
 
 
492 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  37.04 
 
 
484 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  37.04 
 
 
484 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  37.27 
 
 
493 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  36.97 
 
 
493 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  37.07 
 
 
493 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  37.27 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  38.12 
 
 
491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  37.55 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  37.55 
 
 
493 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  37.55 
 
 
493 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  37.8 
 
 
484 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  36.8 
 
 
492 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  37.07 
 
 
491 aa  317  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  39 
 
 
487 aa  316  6e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  35.03 
 
 
506 aa  316  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  32.27 
 
 
503 aa  315  8e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  36.66 
 
 
486 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  37.91 
 
 
481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  39.21 
 
 
486 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  39.21 
 
 
486 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  37.4 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  36.18 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  36.18 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  36.35 
 
 
488 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  38.75 
 
 
475 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  38.75 
 
 
475 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  38.75 
 
 
475 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  38.75 
 
 
475 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  38.98 
 
 
486 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  36.67 
 
 
495 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  38.03 
 
 
486 aa  309  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>