More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1877 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 506 aa  1011    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  36.42 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  35.03 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  34.44 
 
 		 518 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.9 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  33.87 
 
 		 500 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  38.57 
 
 		 506 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  39.28 
 
 		 504 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  33.2 
 
 		 500 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.86 
 
 		 496 aa  296  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  35.14 
 
 		 511 aa  296  9e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  36.51 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  35.5 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.93 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  39.55 
 
 		 505 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  37.12 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  31.33 
 
 		 492 aa  276  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  35.96 
 
 		 499 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  31.33 
 
 		 492 aa  276  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  35.21 
 
 		 511 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.05 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.99 
 
 		 502 aa  273  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  34.79 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  34.79 
 
 		 517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  34.22 
 
 		 488 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  33 
 
 		 503 aa  270  5e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  33.94 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  38.05 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  31.29 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  35.73 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  31.85 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  38.3 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  35.96 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  35.67 
 
 		 493 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  35.67 
 
 		 493 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.7 
 
 		 493 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  34.33 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.27 
 
 		 493 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.58 
 
 		 497 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.48 
 
 		 493 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  36.82 
 
 		 492 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  36.82 
 
 		 492 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  29.8 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  32 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  35.69 
 
 		 493 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  36.62 
 
 		 493 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  33.06 
 
 		 484 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.06 
 
 		 484 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.06 
 
 		 484 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  33.06 
 
 		 484 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  33.06 
 
 		 484 aa  242  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.06 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  37.98 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  37.98 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  35.46 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  37.98 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  37.98 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  36.22 
 
 		 492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.61 
 
 		 489 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  32.86 
 
 		 484 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  34.82 
 
 		 494 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  32.86 
 
 		 484 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  34.69 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  36.11 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.01 
 
 		 493 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  34.42 
 
 		 524 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  36.23 
 
 		 492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  33.06 
 
 		 487 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  32.39 
 
 		 484 aa  236  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.39 
 
 		 538 aa  236  9e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  33.26 
 
 		 489 aa  236  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  37.53 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  37.53 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  37.53 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  35.83 
 
 		 492 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  37.56 
 
 		 501 aa  233  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  28.99 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  33.06 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  31.03 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.77 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  33.06 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2076  carbohydrate kinase, FGGY  34.63 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00125408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  30.83 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  30.83 
 
 		 484 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  29.59 
 
 		 506 aa  229  8e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  35.59 
 
 		 508 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  31.56 
 
 		 509 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  36.04 
 
 		 491 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  29.59 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  35.43 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  36.58 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.91 
 
 		 485 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  26.63 
 
 		 506 aa  228  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  30.63 
 
 		 484 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  33.73 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  31.44 
 
 		 484 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  33.94 
 
 		 496 aa  226  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  33.6 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  31.44 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  33.81 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>