More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0567 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  64.2 
 
 
509 aa  649    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  100 
 
 
502 aa  1036    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  53.8 
 
 
518 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  56.4 
 
 
512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  53.8 
 
 
500 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  55.31 
 
 
511 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  51 
 
 
509 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  53.41 
 
 
496 aa  538  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  51.2 
 
 
515 aa  531  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  51.21 
 
 
504 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  51.22 
 
 
506 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  49 
 
 
501 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  50.1 
 
 
498 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  49 
 
 
511 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  50.7 
 
 
505 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  47.2 
 
 
509 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  45.74 
 
 
499 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  41.8 
 
 
500 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  41.57 
 
 
499 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  42.4 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  41 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  41.39 
 
 
511 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  41.13 
 
 
517 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  40.61 
 
 
503 aa  395  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  40.04 
 
 
492 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  41.13 
 
 
517 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  40.04 
 
 
492 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  39.8 
 
 
483 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  39.32 
 
 
490 aa  353  5.9999999999999994e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  39.92 
 
 
484 aa  352  7e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  41.12 
 
 
499 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  37.7 
 
 
496 aa  347  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  36.09 
 
 
503 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  39.36 
 
 
484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  39.36 
 
 
484 aa  340  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  39.36 
 
 
484 aa  340  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  39.36 
 
 
484 aa  340  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  39.36 
 
 
484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  39.24 
 
 
486 aa  339  8e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  39.52 
 
 
485 aa  338  9e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  39.36 
 
 
484 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  35.07 
 
 
494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  36 
 
 
497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  36.58 
 
 
493 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  37.22 
 
 
484 aa  335  7.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  39.16 
 
 
484 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  39.16 
 
 
484 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  38.48 
 
 
483 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.6 
 
 
494 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  38.56 
 
 
487 aa  332  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  40 
 
 
485 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  37.97 
 
 
484 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  37.77 
 
 
484 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  37.77 
 
 
484 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  37.77 
 
 
484 aa  329  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  36.31 
 
 
492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.66 
 
 
493 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  38.31 
 
 
486 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  36.33 
 
 
493 aa  324  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  38.31 
 
 
484 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  39.04 
 
 
482 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  38.31 
 
 
484 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  38.31 
 
 
484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  39.62 
 
 
496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  38.69 
 
 
495 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.06 
 
 
493 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.06 
 
 
493 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  35.06 
 
 
493 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  35.26 
 
 
486 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  35.35 
 
 
493 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  35.06 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  37.5 
 
 
486 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  35.06 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  38 
 
 
492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  38 
 
 
492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  35.39 
 
 
488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  35.27 
 
 
512 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  37.6 
 
 
492 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  34.52 
 
 
506 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  38.97 
 
 
488 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  38.97 
 
 
488 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  35.46 
 
 
478 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  34.54 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  39.01 
 
 
492 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  34.27 
 
 
511 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  37.65 
 
 
486 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  34.67 
 
 
512 aa  306  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  38.73 
 
 
488 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  34.27 
 
 
512 aa  306  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  37.41 
 
 
486 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.77 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  36.02 
 
 
501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  40.22 
 
 
492 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  35.38 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  37.18 
 
 
486 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  34.87 
 
 
512 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  35 
 
 
472 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  33.93 
 
 
506 aa  302  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  33.94 
 
 
487 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  37.18 
 
 
486 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>