More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2515 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  100 
 
 		 472 aa  919    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  65.68 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  59.41 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  48.51 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  46.26 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  46.79 
 
 		 481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  36.59 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  48.4 
 
 		 478 aa  346  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  48.35 
 
 		 488 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  45.91 
 
 		 503 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  38.6 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  47.91 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  48.76 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  47.44 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  48.55 
 
 		 483 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  48.55 
 
 		 483 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  47.1 
 
 		 478 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  37.72 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  35.9 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  46.46 
 
 		 474 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  39.84 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  40.67 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  39.84 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  36 
 
 		 509 aa  316  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  46.25 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  46.25 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  37.03 
 
 		 496 aa  312  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  40.64 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  35.13 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  45.72 
 
 		 524 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  32.67 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  37.27 
 
 		 511 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  36.83 
 
 		 517 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  36.83 
 
 		 517 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  39.84 
 
 		 506 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  36.11 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  38.84 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  37.4 
 
 		 505 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  42.39 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  32.17 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  32.17 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  31.82 
 
 		 490 aa  280  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  38.1 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  37.68 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  37.88 
 
 		 492 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  30.86 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  30.74 
 
 		 489 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.06 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  35 
 
 		 530 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  36.2 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  36.12 
 
 		 493 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  36.59 
 
 		 493 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  40.76 
 
 		 487 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  37.27 
 
 		 492 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  37.27 
 
 		 492 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  38.26 
 
 		 492 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  38.74 
 
 		 492 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  36.72 
 
 		 484 aa  259  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  36.72 
 
 		 484 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  36.72 
 
 		 484 aa  259  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  36.72 
 
 		 484 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  36.72 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  37.01 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  37.01 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.71 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  36.72 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  37.47 
 
 		 484 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  36.51 
 
 		 484 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  31.79 
 
 		 488 aa  256  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  37.5 
 
 		 486 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.67 
 
 		 493 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  36.81 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  36.12 
 
 		 506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  35.92 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.71 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  37.21 
 
 		 493 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  37.21 
 
 		 493 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  37.76 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  38.02 
 
 		 483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  33.2 
 
 		 514 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  36.59 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  35.54 
 
 		 484 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  36.63 
 
 		 484 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  36.98 
 
 		 485 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  38.13 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  36.61 
 
 		 492 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  32.85 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  36.39 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  38.13 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  37.19 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  36.36 
 
 		 493 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  35.54 
 
 		 484 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  35.77 
 
 		 484 aa  251  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  38.18 
 
 		 490 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  32.58 
 
 		 494 aa  249  5e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  38.18 
 
 		 490 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  35.54 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  30.08 
 
 		 497 aa  249  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  37.01 
 
 		 492 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  36.72 
 
 		 492 aa  249  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>