More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1575 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  100 
 
 		 478 aa  921    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  49.04 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  47.85 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  48.42 
 
 		 481 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  45.78 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  45.29 
 
 		 477 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  42.45 
 
 		 506 aa  277  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  43.37 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4202  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  49.22 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  44.98 
 
 		 474 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  44.98 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  44.98 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  44.42 
 
 		 503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  44.55 
 
 		 488 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  45.29 
 
 		 483 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  45.29 
 
 		 483 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  44.34 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  44.34 
 
 		 483 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  44.83 
 
 		 478 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  44.8 
 
 		 488 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  37.45 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  38.94 
 
 		 512 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  34.22 
 
 		 500 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  35.54 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  32.15 
 
 		 509 aa  240  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.77 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  33.19 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  36.61 
 
 		 491 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.34 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.05 
 
 		 501 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.36 
 
 		 518 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.94 
 
 		 498 aa  223  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  34.54 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  31.82 
 
 		 486 aa  220  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  33.18 
 
 		 494 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.74 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.74 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.06 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.87 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.96 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  35.86 
 
 		 484 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  36.58 
 
 		 496 aa  216  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  34.62 
 
 		 494 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  35.7 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  36.57 
 
 		 496 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.31 
 
 		 493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  35.93 
 
 		 483 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  35.99 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  37.3 
 
 		 481 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  33.87 
 
 		 484 aa  213  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  36.79 
 
 		 505 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  32.72 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  34.79 
 
 		 484 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  35.7 
 
 		 526 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  35.73 
 
 		 511 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.96 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  34.85 
 
 		 493 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  33.54 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  35.31 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  33.87 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  33.94 
 
 		 484 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.39 
 
 		 499 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  33.54 
 
 		 493 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  33.54 
 
 		 493 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  34.21 
 
 		 493 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.34 
 
 		 500 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  33.72 
 
 		 484 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  33.56 
 
 		 484 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.72 
 
 		 484 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.72 
 
 		 484 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  33.72 
 
 		 484 aa  206  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.56 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  35.15 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  33.54 
 
 		 493 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  35.15 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  35.65 
 
 		 493 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  35.48 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  35.15 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  35.15 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.72 
 
 		 484 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  34.55 
 
 		 484 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  31.97 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  32.14 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  32.14 
 
 		 484 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.4 
 
 		 496 aa  202  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  35.54 
 
 		 485 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  32.14 
 
 		 484 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.56 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  35.17 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  35 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  32.16 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  35 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  36.26 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  32.14 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  36.71 
 
 		 478 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  34.78 
 
 		 484 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  34.02 
 
 		 489 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.4 
 
 		 497 aa  199  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.06 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  31.07 
 
 		 503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>