More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2605 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  92.42 
 
 		 488 aa  785    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  87.08 
 
 		 503 aa  784    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 483 aa  920    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  89.14 
 
 		 488 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 483 aa  920    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  85.3 
 
 		 478 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  97.1 
 
 		 483 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  68.67 
 
 		 474 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  68.67 
 
 		 524 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  68.88 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  65.02 
 
 		 481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  63.33 
 
 		 506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  68.88 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  66.04 
 
 		 474 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  69.58 
 
 		 525 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  69.58 
 
 		 525 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  49.38 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  46.91 
 
 		 481 aa  332  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  47.93 
 
 		 472 aa  326  5e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  41.31 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  44.78 
 
 		 478 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.37 
 
 		 501 aa  252  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.06 
 
 		 509 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  37.1 
 
 		 511 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.91 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.42 
 
 		 498 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.27 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.04 
 
 		 511 aa  227  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.89 
 
 		 492 aa  226  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.89 
 
 		 492 aa  226  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.56 
 
 		 502 aa  226  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.36 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.22 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  37.11 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.14 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.99 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  35.03 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.27 
 
 		 512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  32.74 
 
 		 488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.48 
 
 		 496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.75 
 
 		 494 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  31.67 
 
 		 486 aa  216  9e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.26 
 
 		 509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  35.35 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.69 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.96 
 
 		 487 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  37.95 
 
 		 492 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.89 
 
 		 489 aa  210  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  37.95 
 
 		 492 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  37.95 
 
 		 492 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  37.87 
 
 		 499 aa  209  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  38.19 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  38.42 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  36.12 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  34.88 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  37.26 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  34.67 
 
 		 496 aa  206  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.39 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  35.87 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  36.21 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  34.03 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  36.19 
 
 		 488 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  34.95 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.78 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  35.66 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  35.66 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  32.57 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  35.66 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  36.45 
 
 		 493 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  32.92 
 
 		 482 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.65 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  34.72 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  36.45 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  34.29 
 
 		 484 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  33.61 
 
 		 483 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  32.62 
 
 		 483 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  35.93 
 
 		 505 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.78 
 
 		 493 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  36.07 
 
 		 485 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  33.06 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  34.14 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  36.18 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  33.73 
 
 		 486 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.57 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  35.42 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  34.53 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  35.42 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  33.48 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  33.48 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  35.18 
 
 		 490 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  35.18 
 
 		 490 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  33.94 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  34.53 
 
 		 493 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  193  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.6 
 
 		 504 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  33.94 
 
 		 483 aa  193  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  33.89 
 
 		 485 aa  192  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>