More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1022 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  100 
 
 
474 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  92.41 
 
 
524 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  99.16 
 
 
474 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  99.79 
 
 
474 aa  897    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  69.49 
 
 
474 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  66.33 
 
 
506 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  66.95 
 
 
481 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  69.29 
 
 
483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  68.26 
 
 
483 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  67.71 
 
 
478 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  68.26 
 
 
483 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  64.34 
 
 
503 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  67.35 
 
 
488 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  99.64 
 
 
525 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  99.64 
 
 
525 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  66.53 
 
 
488 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  48.43 
 
 
472 aa  323  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  46.25 
 
 
472 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  46.39 
 
 
481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  41.18 
 
 
477 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  44.55 
 
 
478 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.69 
 
 
509 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.61 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  36.89 
 
 
493 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  36.2 
 
 
493 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  36.48 
 
 
488 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  36.27 
 
 
493 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.8 
 
 
500 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  36.48 
 
 
493 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  36.48 
 
 
493 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  35.63 
 
 
511 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.06 
 
 
501 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  36.81 
 
 
491 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  37.01 
 
 
493 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  36.07 
 
 
493 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  36.23 
 
 
493 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.98 
 
 
492 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.98 
 
 
492 aa  224  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.99 
 
 
493 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  37.14 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  35.61 
 
 
484 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  35.33 
 
 
496 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  37.55 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.74 
 
 
511 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.02 
 
 
488 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.66 
 
 
498 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.54 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  36.82 
 
 
484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  37.64 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  37.64 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  37.64 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  37.64 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  33.06 
 
 
492 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.8 
 
 
496 aa  213  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  36.59 
 
 
484 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.89 
 
 
518 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  37.5 
 
 
486 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  35.07 
 
 
484 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  35.21 
 
 
484 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.14 
 
 
489 aa  209  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.74 
 
 
483 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  37.61 
 
 
493 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  37.61 
 
 
493 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  37.61 
 
 
493 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.89 
 
 
496 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  36.03 
 
 
496 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.05 
 
 
515 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  34.83 
 
 
484 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  31.19 
 
 
486 aa  206  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  32.24 
 
 
486 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  34.24 
 
 
484 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  34.24 
 
 
484 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  34.24 
 
 
484 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  36.9 
 
 
485 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  35 
 
 
484 aa  202  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  34.93 
 
 
486 aa  202  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.55 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  35 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  35 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  35 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  35.03 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.24 
 
 
500 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  34.23 
 
 
484 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  37.14 
 
 
492 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  34.17 
 
 
489 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  31.77 
 
 
482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  37.36 
 
 
508 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  37.14 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  33.26 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  37.14 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  37.14 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  37.14 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  34.55 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  33.54 
 
 
492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.89 
 
 
512 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  33.54 
 
 
483 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  36.88 
 
 
478 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  30.89 
 
 
494 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.99 
 
 
504 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>