More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2525 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  87.67 
 
 		 488 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  82.7 
 
 		 478 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 503 aa  957    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  86.68 
 
 		 483 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  94.23 
 
 		 488 aa  844    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  86.68 
 
 		 483 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  86.88 
 
 		 483 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  63.73 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  61.78 
 
 		 481 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  64.94 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  63.94 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  60.23 
 
 		 506 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  64.34 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  64.34 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  46.51 
 
 		 472 aa  348  9e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  63.4 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  63.4 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  46.84 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  45.63 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  41.18 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  43.75 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.85 
 
 		 501 aa  239  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.43 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  35.58 
 
 		 511 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.14 
 
 		 515 aa  226  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  36.13 
 
 		 496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.31 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.74 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.86 
 
 		 509 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  36.31 
 
 		 492 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.13 
 
 		 509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.66 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.58 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.19 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.58 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.98 
 
 		 500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.29 
 
 		 490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.65 
 
 		 502 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  38.18 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  38.18 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.25 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  37.73 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  37.5 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.46 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  33.73 
 
 		 496 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.42 
 
 		 489 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.56 
 
 		 499 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.39 
 
 		 488 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  37.5 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.27 
 
 		 496 aa  203  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  30.26 
 
 		 486 aa  203  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.02 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.06 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  34.17 
 
 		 494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  35.52 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  34.39 
 
 		 491 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  36.59 
 
 		 492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  31.76 
 
 		 487 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  33.66 
 
 		 493 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  33.66 
 
 		 493 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  33.41 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  34.85 
 
 		 487 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  37.1 
 
 		 499 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.63 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  33.94 
 
 		 493 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  34.77 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  33.94 
 
 		 493 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  33.87 
 
 		 493 aa  193  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.79 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.46 
 
 		 504 aa  193  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  33.56 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.44 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  31.74 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  34.92 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  33.11 
 
 		 489 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.74 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  34.55 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.31 
 
 		 530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.56 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.56 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  33.56 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32 
 
 		 484 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  32.13 
 
 		 483 aa  189  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.7 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  34.41 
 
 		 490 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  33.73 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  34.41 
 
 		 490 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  32.03 
 
 		 515 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  32.88 
 
 		 485 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  32.57 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  34.18 
 
 		 490 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  34.18 
 
 		 490 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  34.1 
 
 		 486 aa  187  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  34.35 
 
 		 493 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.42 
 
 		 499 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  32.54 
 
 		 484 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  33.86 
 
 		 486 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>