More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3254 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 506 aa  998    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  90.47 
 
 		 481 aa  863    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  75.77 
 
 		 474 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  66.12 
 
 		 474 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  66.33 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  66.46 
 
 		 524 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  66.12 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  63.65 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  62.93 
 
 		 483 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  62.93 
 
 		 483 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  60.23 
 
 		 503 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  62.62 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  62.47 
 
 		 478 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  61.83 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  46.26 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  63.55 
 
 		 525 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  63.55 
 
 		 525 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  47.47 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  43.64 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  41.06 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  42.15 
 
 		 478 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  32.36 
 
 		 500 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.58 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.92 
 
 		 501 aa  243  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.88 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.66 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  32.4 
 
 		 511 aa  237  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  35.54 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  30.66 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.06 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.19 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  33.6 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  34.61 
 
 		 492 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.2 
 
 		 493 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.94 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.25 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  33.99 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.25 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.08 
 
 		 498 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.86 
 
 		 500 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.27 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  36.09 
 
 		 487 aa  217  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.41 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.19 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  34.2 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  33.86 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  33.8 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  36.29 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  31.72 
 
 		 484 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.58 
 
 		 488 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  34.48 
 
 		 506 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  31.94 
 
 		 486 aa  206  9e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.44 
 
 		 490 aa  206  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.4 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  33.26 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  31.85 
 
 		 495 aa  204  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  31.96 
 
 		 488 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  35.66 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  33.86 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  35.66 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  35.66 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  32.06 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.72 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  32.51 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.6 
 
 		 496 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  31.23 
 
 		 486 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  33.86 
 
 		 493 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.61 
 
 		 499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.55 
 
 		 499 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  33.6 
 
 		 493 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  32.51 
 
 		 484 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  35.27 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  33.6 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  33.6 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  35.27 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  36.13 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  35.27 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  35.27 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  36.36 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.26 
 
 		 484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  34.25 
 
 		 493 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.87 
 
 		 504 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  32.6 
 
 		 483 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  34.21 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  33.26 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  35.02 
 
 		 493 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  35.02 
 
 		 493 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  33.49 
 
 		 486 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  35.02 
 
 		 493 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  31.06 
 
 		 483 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  33.49 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  34.93 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  34.65 
 
 		 508 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.6 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  33.26 
 
 		 475 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  33.94 
 
 		 488 aa  191  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  33.26 
 
 		 475 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  33.26 
 
 		 475 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  33.26 
 
 		 475 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  34.17 
 
 		 488 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>