More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5936 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  87.67 
 
 
503 aa  782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  92.62 
 
 
483 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
488 aa  932    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  92.62 
 
 
483 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  83.81 
 
 
478 aa  715    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  89.55 
 
 
488 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  92.62 
 
 
483 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  66.94 
 
 
474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  67.56 
 
 
524 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  63.88 
 
 
481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  65.08 
 
 
474 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  62.62 
 
 
506 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  67.35 
 
 
474 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  67.35 
 
 
474 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  49.08 
 
 
472 aa  361  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  67.7 
 
 
525 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  67.7 
 
 
525 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  48.35 
 
 
472 aa  332  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  47.31 
 
 
481 aa  329  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  43.27 
 
 
477 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  44.34 
 
 
478 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.6 
 
 
501 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  31.45 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  31.45 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.96 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  36.82 
 
 
511 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.38 
 
 
509 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.27 
 
 
498 aa  230  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.19 
 
 
511 aa  226  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.22 
 
 
496 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.49 
 
 
518 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.31 
 
 
502 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.54 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.4 
 
 
515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.01 
 
 
499 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  32.44 
 
 
488 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  36.84 
 
 
496 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.67 
 
 
490 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.7 
 
 
500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.65 
 
 
512 aa  216  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  38.44 
 
 
492 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.65 
 
 
496 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.9 
 
 
494 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.58 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  38.44 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  38.44 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  38.68 
 
 
492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  36.38 
 
 
492 aa  213  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  37.23 
 
 
493 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  38.44 
 
 
492 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  36.75 
 
 
493 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  36.49 
 
 
493 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  34.42 
 
 
496 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  30.99 
 
 
486 aa  208  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.48 
 
 
487 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  37.05 
 
 
493 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  37.05 
 
 
493 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  32.4 
 
 
530 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  36.15 
 
 
491 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  37.05 
 
 
493 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  36.62 
 
 
493 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  37.05 
 
 
493 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  37.42 
 
 
499 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  34.71 
 
 
489 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.25 
 
 
489 aa  202  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  34.33 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  35.95 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  36 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  35.95 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  34.17 
 
 
484 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  34.48 
 
 
484 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.33 
 
 
483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  35.71 
 
 
490 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  37.5 
 
 
492 aa  200  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  35.71 
 
 
490 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  36.02 
 
 
493 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.43 
 
 
488 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  32.86 
 
 
482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  34.71 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  35.32 
 
 
505 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  37.09 
 
 
501 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  35.25 
 
 
493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  35.98 
 
 
485 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  36.41 
 
 
493 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  36.41 
 
 
493 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  36.41 
 
 
493 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  34.26 
 
 
517 aa  196  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  32.92 
 
 
483 aa  196  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  34.26 
 
 
517 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  34.02 
 
 
484 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  33.97 
 
 
484 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.87 
 
 
504 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  34.84 
 
 
491 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  35.58 
 
 
499 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  33.63 
 
 
515 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  34.76 
 
 
487 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  35 
 
 
526 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  33.87 
 
 
484 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  33.65 
 
 
486 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  31.75 
 
 
492 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>