More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0712 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  91.48 
 
 
506 aa  873    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  100 
 
 
481 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  77.68 
 
 
474 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  66.74 
 
 
474 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  67.15 
 
 
524 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  66.95 
 
 
474 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  66.74 
 
 
474 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  65.15 
 
 
483 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  64.4 
 
 
483 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  64.4 
 
 
483 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  61.78 
 
 
503 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  64.08 
 
 
488 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  63.47 
 
 
488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  63.2 
 
 
478 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  47.2 
 
 
472 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  48.24 
 
 
472 aa  333  3e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  65.16 
 
 
525 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  65.16 
 
 
525 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  45.34 
 
 
481 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  41.27 
 
 
477 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  43.32 
 
 
478 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.92 
 
 
500 aa  252  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.1 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.38 
 
 
494 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.38 
 
 
493 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.61 
 
 
509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.07 
 
 
509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.36 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  35.88 
 
 
492 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.85 
 
 
496 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  35.7 
 
 
511 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.98 
 
 
502 aa  229  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.77 
 
 
518 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.58 
 
 
493 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.75 
 
 
492 aa  229  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.58 
 
 
511 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.75 
 
 
492 aa  229  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.22 
 
 
491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.02 
 
 
489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.5 
 
 
498 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  31.22 
 
 
496 aa  220  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  35.1 
 
 
496 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.22 
 
 
493 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.76 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.86 
 
 
500 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.04 
 
 
509 aa  216  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  35.33 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.67 
 
 
493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.4 
 
 
493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  33.27 
 
 
488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.8 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  32.59 
 
 
492 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.8 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  34.33 
 
 
484 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  33.13 
 
 
484 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  36.93 
 
 
490 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  36.93 
 
 
490 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  36.93 
 
 
490 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  36.93 
 
 
490 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.33 
 
 
493 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.33 
 
 
499 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.1 
 
 
488 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  31.85 
 
 
495 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  33.94 
 
 
493 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.85 
 
 
515 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  36.1 
 
 
496 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  33.87 
 
 
484 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  34.3 
 
 
506 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  31.98 
 
 
486 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.95 
 
 
499 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.49 
 
 
490 aa  206  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  33.87 
 
 
484 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  36.67 
 
 
493 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  36.38 
 
 
533 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  36.67 
 
 
493 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  36.67 
 
 
493 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  32.95 
 
 
489 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  36.36 
 
 
492 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  36.36 
 
 
492 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  36.36 
 
 
492 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  33.33 
 
 
486 aa  202  8e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  36.36 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  36.36 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.4 
 
 
506 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  35.2 
 
 
492 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  34.05 
 
 
483 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  34.05 
 
 
483 aa  200  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  33.74 
 
 
483 aa  200  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  35.83 
 
 
499 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  36.12 
 
 
508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  32.16 
 
 
484 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  35.12 
 
 
526 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  34.27 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  34.42 
 
 
488 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  34.2 
 
 
486 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  33.4 
 
 
483 aa  196  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  34.43 
 
 
488 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  34.43 
 
 
488 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  30.32 
 
 
494 aa  196  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  33.57 
 
 
484 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>