More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2629 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  92.42 
 
 		 488 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  86.88 
 
 		 503 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  97.1 
 
 		 483 aa  836    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  85.71 
 
 		 478 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  88.73 
 
 		 488 aa  772    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  97.1 
 
 		 483 aa  836    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 483 aa  926    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  68.88 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  66.39 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  69.29 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  63.65 
 
 		 506 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  69.09 
 
 		 524 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  65.15 
 
 		 481 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  69.29 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  70.63 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  70.63 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  49.59 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  46.31 
 
 		 481 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  48.24 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  42.4 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  43.81 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.42 
 
 		 501 aa  253  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.09 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.47 
 
 		 500 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.8 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.8 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  37.42 
 
 		 511 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.11 
 
 		 511 aa  227  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.42 
 
 		 502 aa  226  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.79 
 
 		 498 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.22 
 
 		 496 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.27 
 
 		 518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  29.56 
 
 		 490 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  36.74 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.34 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.6 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.41 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.75 
 
 		 494 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  35.9 
 
 		 496 aa  216  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.51 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  32.52 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  31.25 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.65 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.45 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.89 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.55 
 
 		 487 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  38.05 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  37.86 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  37.86 
 
 		 492 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  37.86 
 
 		 492 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.63 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  34.29 
 
 		 496 aa  207  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  37.62 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  36.78 
 
 		 493 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  37.86 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.19 
 
 		 493 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.89 
 
 		 493 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  32.79 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  35.87 
 
 		 486 aa  204  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  34.42 
 
 		 489 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.55 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  32.71 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  35.45 
 
 		 493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  35.45 
 
 		 493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  34.35 
 
 		 511 aa  200  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  36.21 
 
 		 493 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  33.56 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  36.21 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  35.45 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  34.49 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  36.05 
 
 		 487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.68 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  29.82 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  33.91 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  36.45 
 
 		 485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  36.83 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  33.91 
 
 		 517 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  34.29 
 
 		 484 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  32.38 
 
 		 483 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  33.88 
 
 		 493 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  35.84 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  33.73 
 
 		 486 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.73 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  35.84 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  34.82 
 
 		 526 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  34.26 
 
 		 484 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  33.1 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  33.49 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  35.7 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  35.59 
 
 		 490 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  35.59 
 
 		 490 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  33.2 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  33.2 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.49 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  32.86 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  35.05 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  33.25 
 
 		 484 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.49 
 
 		 484 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  32.86 
 
 		 484 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.49 
 
 		 484 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>