More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2478 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 477 aa  946    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  46.27 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  47.7 
 
 		 472 aa  355  7.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  48.51 
 
 		 472 aa  349  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  45.45 
 
 		 478 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  41.06 
 
 		 506 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  42.2 
 
 		 474 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  41.04 
 
 		 481 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  41.18 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  42.79 
 
 		 474 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  42.79 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  43.4 
 
 		 488 aa  276  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  41.58 
 
 		 503 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.8 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  41.6 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  34.99 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  42.47 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  42.4 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  42.24 
 
 		 483 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  42.24 
 
 		 483 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  42.44 
 
 		 488 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  36.4 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  33.04 
 
 		 500 aa  254  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.96 
 
 		 512 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  33.76 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.13 
 
 		 509 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.72 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.72 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  34.09 
 
 		 483 aa  243  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.37 
 
 		 493 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  33.88 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.71 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.47 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  35.54 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  33.68 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  35.55 
 
 		 490 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  35.55 
 
 		 490 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  35.55 
 
 		 490 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  35.55 
 
 		 490 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  33.33 
 
 		 489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  33.95 
 
 		 493 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.39 
 
 		 509 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  33.75 
 
 		 484 aa  232  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.91 
 
 		 511 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  35.7 
 
 		 492 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  33.33 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  37.28 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.37 
 
 		 493 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  33.4 
 
 		 493 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  31.5 
 
 		 489 aa  229  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.75 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  35.31 
 
 		 496 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.29 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  35.19 
 
 		 499 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  32.72 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  36.74 
 
 		 511 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  34.91 
 
 		 515 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  35.29 
 
 		 492 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  35.29 
 
 		 492 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  36.84 
 
 		 506 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  32.67 
 
 		 483 aa  226  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.26 
 
 		 511 aa  226  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  35.12 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  35.12 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.84 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.84 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  35.12 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  33.33 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  34.53 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.84 
 
 		 493 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  34.1 
 
 		 484 aa  225  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.95 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  35.29 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  35.78 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  35.78 
 
 		 517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  32.3 
 
 		 484 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  35.26 
 
 		 484 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.25 
 
 		 490 aa  220  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  32.92 
 
 		 492 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  31.62 
 
 		 512 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  32.64 
 
 		 492 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  35.29 
 
 		 492 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  31.69 
 
 		 484 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  30.96 
 
 		 494 aa  218  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  34.39 
 
 		 487 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  29.94 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4202  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  36.46 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  34.99 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  37.07 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.68 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  33.79 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  32.8 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  33.12 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  33.57 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  32.05 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.46 
 
 		 488 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  33.56 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  34.36 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  34.92 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  33.73 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>