More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1285 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  100 
 
 		 512 aa  1042    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  47.37 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.87 
 
 		 509 aa  272  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  34.58 
 
 		 548 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  31.13 
 
 		 503 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.37 
 
 		 501 aa  243  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.98 
 
 		 518 aa  238  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.67 
 
 		 496 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.85 
 
 		 515 aa  236  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.12 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  33.87 
 
 		 498 aa  233  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  37.11 
 
 		 498 aa  230  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.6 
 
 		 502 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.07 
 
 		 511 aa  223  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.75 
 
 		 512 aa  219  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.02 
 
 		 504 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  31.95 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.13 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  31.94 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  31.48 
 
 		 508 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.2 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.55 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.62 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 		 497 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  31.45 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  30.33 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.71 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.33 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  29.09 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.63 
 
 		 503 aa  211  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  33.33 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.93 
 
 		 501 aa  206  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.6 
 
 		 500 aa  203  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  31.89 
 
 		 524 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  33.74 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  35.45 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  31.62 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  33.13 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  33.73 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  29.86 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.28 
 
 		 506 aa  200  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  31.16 
 
 		 505 aa  200  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.88 
 
 		 511 aa  200  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.88 
 
 		 496 aa  199  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.24 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.83 
 
 		 514 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.43 
 
 		 499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  32.21 
 
 		 493 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  32.21 
 
 		 493 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  29.63 
 
 		 505 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  35.78 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.28 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  34.43 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  27.15 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.73 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.73 
 
 		 484 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  31.8 
 
 		 484 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  32.01 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  31.8 
 
 		 484 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.06 
 
 		 506 aa  193  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  29.67 
 
 		 538 aa  192  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  33.81 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.57 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  31.6 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  32.87 
 
 		 501 aa  190  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  28.77 
 
 		 494 aa  190  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  29.48 
 
 		 515 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  29.48 
 
 		 515 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  31.4 
 
 		 484 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  29.48 
 
 		 515 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.48 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  30.65 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.74 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.74 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  30.86 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  30.86 
 
 		 484 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  30.86 
 
 		 484 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  30.86 
 
 		 484 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.96 
 
 		 488 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  30.43 
 
 		 508 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  31.98 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  28.04 
 
 		 513 aa  186  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.98 
 
 		 493 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  30.86 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  29.75 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  29.35 
 
 		 495 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  30.72 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  30.86 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.35 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.83 
 
 		 513 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.02 
 
 		 512 aa  183  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  33.87 
 
 		 533 aa  183  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  27.83 
 
 		 513 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  30.86 
 
 		 508 aa  183  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  27.61 
 
 		 513 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  27.61 
 
 		 513 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  24.31 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  30.28 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  27.83 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  27.39 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>