More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3323 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
519 aa  1072    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.53 
 
 
512 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31 
 
 
500 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.2 
 
 
509 aa  267  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  30.21 
 
 
530 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.46 
 
 
502 aa  259  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.09 
 
 
511 aa  253  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.2 
 
 
509 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.51 
 
 
518 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.29 
 
 
511 aa  251  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.75 
 
 
498 aa  247  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.78 
 
 
503 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.19 
 
 
513 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.19 
 
 
513 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.19 
 
 
513 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.54 
 
 
501 aa  243  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.19 
 
 
513 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.29 
 
 
496 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  29.58 
 
 
512 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  28.6 
 
 
513 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  29.04 
 
 
513 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  28.4 
 
 
513 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.6 
 
 
513 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  29.19 
 
 
506 aa  239  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.6 
 
 
504 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.59 
 
 
514 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  29.98 
 
 
512 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.04 
 
 
499 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  30.31 
 
 
519 aa  236  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  28.13 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.66 
 
 
515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.74 
 
 
509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.24 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  29.35 
 
 
512 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  29.35 
 
 
511 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  29.01 
 
 
513 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  28.99 
 
 
511 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  28.97 
 
 
512 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.21 
 
 
506 aa  230  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  28.65 
 
 
511 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.77 
 
 
538 aa  228  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  28.65 
 
 
511 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.57 
 
 
489 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.57 
 
 
500 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  28.27 
 
 
511 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.16 
 
 
497 aa  224  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  28.77 
 
 
518 aa  222  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.85 
 
 
512 aa  219  7.999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  26.16 
 
 
517 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  26.16 
 
 
517 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.33 
 
 
512 aa  216  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  29.77 
 
 
526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.54 
 
 
505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29.88 
 
 
510 aa  213  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  28.52 
 
 
505 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.29 
 
 
509 aa  211  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.47 
 
 
548 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  29.86 
 
 
501 aa  207  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.65 
 
 
499 aa  206  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.27 
 
 
506 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  28.96 
 
 
519 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  29.98 
 
 
511 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.28 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  28 
 
 
509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  29.57 
 
 
517 aa  200  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  29.57 
 
 
517 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  29.29 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  28.85 
 
 
499 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.31 
 
 
506 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.27 
 
 
506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.75 
 
 
497 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.05 
 
 
511 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  29.94 
 
 
530 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.31 
 
 
508 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  29.48 
 
 
472 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.53 
 
 
496 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.53 
 
 
514 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.49 
 
 
524 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.21 
 
 
502 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  28.29 
 
 
524 aa  190  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.7 
 
 
514 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  27.64 
 
 
519 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5747  glycerol kinase  30.12 
 
 
488 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259749  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  26.56 
 
 
496 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  29.23 
 
 
499 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  28.11 
 
 
493 aa  187  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  28 
 
 
501 aa  186  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  25.35 
 
 
489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  27.93 
 
 
503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.79 
 
 
521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  26.17 
 
 
496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.4 
 
 
530 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  28.4 
 
 
530 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.4 
 
 
530 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  29.62 
 
 
530 aa  183  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0084  glycerol kinase  29.04 
 
 
489 aa  183  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  29.42 
 
 
530 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  26.46 
 
 
496 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.32 
 
 
512 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  28.91 
 
 
521 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.354732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>