More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0084 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0084  glycerol kinase  100 
 
 		 489 aa  964    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2441  carbohydrate kinase, FGGY  61.83 
 
 		 487 aa  544  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1948  carbohydrate kinase, FGGY  59.51 
 
 		 490 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.148996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  53.47 
 
 		 502 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  51.61 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  50.82 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  53.16 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  52.57 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  53.29 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  49.9 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  49.49 
 
 		 498 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  49.07 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  51.54 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  50.82 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  52.14 
 
 		 502 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  51.55 
 
 		 495 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  48.67 
 
 		 497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  49.18 
 
 		 503 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  51.34 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  50.6 
 
 		 497 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  48.35 
 
 		 494 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  49.08 
 
 		 497 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  49.69 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  49.29 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  49.9 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  47.97 
 
 		 497 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  48.98 
 
 		 497 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  50.72 
 
 		 496 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  46.52 
 
 		 501 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  49.39 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  50.62 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  48.36 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  46.72 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  48.97 
 
 		 494 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  48.87 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  48.99 
 
 		 500 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  48.37 
 
 		 498 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  51.35 
 
 		 497 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  46.41 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  48.27 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  48.37 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  47.76 
 
 		 519 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  49.49 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  49.9 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  51.23 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  48.77 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  48.28 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  47.47 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  49.26 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  45.9 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  47.84 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  45.79 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  48.26 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  49.8 
 
 		 503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  47.03 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  48.06 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  48.26 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  49.08 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  47.76 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  47.85 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  48.26 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  46.84 
 
 		 494 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  46.11 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  46.84 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  46.84 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  46.94 
 
 		 494 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  46.31 
 
 		 496 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  46.31 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  47.44 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  48.06 
 
 		 500 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  47.14 
 
 		 519 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  47.44 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  46.31 
 
 		 496 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  50.21 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  47.44 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  47.24 
 
 		 500 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  49.08 
 
 		 498 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  46.95 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  47.44 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  47.37 
 
 		 500 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  45.62 
 
 		 493 aa  448  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  46.64 
 
 		 494 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  46.82 
 
 		 498 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  50.82 
 
 		 504 aa  448  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  46.22 
 
 		 498 aa  450  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  46.64 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  46.11 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  47.25 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  47.44 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  47.44 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  46.31 
 
 		 496 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  47.44 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  47.05 
 
 		 494 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1721  glycerol kinase  48.69 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  46.11 
 
 		 496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  50.72 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  45.92 
 
 		 494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  46.84 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  49.59 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  49.08 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>