More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1382 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.38 
 
 
530 aa  865    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.08 
 
 
530 aa  875    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.29 
 
 
516 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.57 
 
 
530 aa  867    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  78.57 
 
 
530 aa  867    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.38 
 
 
530 aa  867    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.29 
 
 
516 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.57 
 
 
530 aa  867    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.08 
 
 
530 aa  877    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  67.83 
 
 
517 aa  724    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.27 
 
 
530 aa  878    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.1 
 
 
516 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.1 
 
 
516 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.29 
 
 
516 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.76 
 
 
530 aa  835    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  100 
 
 
521 aa  1077    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  79.38 
 
 
530 aa  862    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  56.32 
 
 
520 aa  634  1e-180  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3745  autoinducer-2 (AI-2) kinase  56.84 
 
 
525 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.83 
 
 
520 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  55.43 
 
 
520 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.88 
 
 
520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.65 
 
 
522 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.84 
 
 
522 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.65 
 
 
520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.86 
 
 
520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.67 
 
 
520 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.45 
 
 
509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.26 
 
 
509 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  52.65 
 
 
388 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.35 
 
 
503 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.09 
 
 
501 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.61 
 
 
509 aa  190  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  32.28 
 
 
509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.2 
 
 
515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  30.66 
 
 
511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.04 
 
 
509 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.39 
 
 
524 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  27.42 
 
 
518 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  28 
 
 
503 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.79 
 
 
519 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.32 
 
 
548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.01 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.83 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.69 
 
 
509 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.98 
 
 
502 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.73 
 
 
506 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  28.6 
 
 
509 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  30.33 
 
 
510 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  30.72 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  27.42 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  26.24 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  29.9 
 
 
505 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.43 
 
 
506 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  27.15 
 
 
512 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.06 
 
 
512 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.63 
 
 
538 aa  161  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.81 
 
 
513 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  27.04 
 
 
481 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.81 
 
 
513 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27.39 
 
 
512 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.81 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.76 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.81 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  27.8 
 
 
514 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.76 
 
 
513 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  26.81 
 
 
513 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.65 
 
 
496 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.4 
 
 
511 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 
515 aa  157  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  28.65 
 
 
514 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  27.84 
 
 
521 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.21 
 
 
513 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.16 
 
 
492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.16 
 
 
492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.4 
 
 
514 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.62 
 
 
500 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.88 
 
 
530 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.41 
 
 
481 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  29.57 
 
 
515 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.96 
 
 
497 aa  150  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  29.61 
 
 
520 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  25.62 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  26.32 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.7 
 
 
496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.16 
 
 
512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  26.13 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  28.16 
 
 
505 aa  148  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  26.55 
 
 
512 aa  148  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  27.33 
 
 
519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  25.69 
 
 
519 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.94 
 
 
499 aa  147  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.45 
 
 
505 aa  146  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.8 
 
 
508 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  26.33 
 
 
498 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  29.62 
 
 
515 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  29.62 
 
 
515 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  29.62 
 
 
515 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  26.33 
 
 
498 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  25.19 
 
 
520 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>