More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2124 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.95 
 
 		 516 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  99.06 
 
 		 530 aa  1083    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.06 
 
 		 530 aa  1086    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.76 
 
 		 521 aa  866    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.95 
 
 		 516 aa  883    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  100 
 
 		 530 aa  1094    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.25 
 
 		 530 aa  1087    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  77.92 
 
 		 530 aa  850    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  67.05 
 
 		 517 aa  713    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.3 
 
 		 530 aa  852    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.95 
 
 		 516 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  98.49 
 
 		 530 aa  1082    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.06 
 
 		 530 aa  1084    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.95 
 
 		 516 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.14 
 
 		 516 aa  884    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  76.83 
 
 		 530 aa  830    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.3 
 
 		 530 aa  852    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.72 
 
 		 520 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.65 
 
 		 520 aa  586  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  55.04 
 
 		 520 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.16 
 
 		 520 aa  579  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.46 
 
 		 522 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.65 
 
 		 522 aa  581  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.46 
 
 		 520 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3745  autoinducer-2 (AI-2) kinase  57.17 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.97 
 
 		 520 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.58 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.03 
 
 		 509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.03 
 
 		 509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  51.99 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.65 
 
 		 503 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.12 
 
 		 518 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.26 
 
 		 515 aa  176  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.8 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.1 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28.12 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.52 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.95 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.52 
 
 		 511 aa  173  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  29.17 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.78 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.24 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.05 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.17 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  31.15 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.86 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.59 
 
 		 548 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  28.88 
 
 		 513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.58 
 
 		 502 aa  163  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  28.09 
 
 		 512 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.88 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.88 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.94 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.88 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  29.06 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.86 
 
 		 513 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.88 
 
 		 513 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.69 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  30.42 
 
 		 519 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.52 
 
 		 500 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  28.69 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.36 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.04 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.76 
 
 		 506 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.87 
 
 		 512 aa  156  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.85 
 
 		 496 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  29.64 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.09 
 
 		 499 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  28.49 
 
 		 514 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  30.21 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  28.1 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.82 
 
 		 497 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.43 
 
 		 506 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  27.27 
 
 		 518 aa  151  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  26.81 
 
 		 516 aa  150  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  26.91 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  29.56 
 
 		 505 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  30.52 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  25.89 
 
 		 493 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  27.97 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  27.25 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  25.15 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  28.12 
 
 		 521 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  26.42 
 
 		 481 aa  147  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  26.99 
 
 		 502 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  25.15 
 
 		 498 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.17 
 
 		 497 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  25.15 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  25.15 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  25.15 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  25.15 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  25.15 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.8 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  26.89 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  27.25 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  26.59 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  25.71 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  24.8 
 
 		 513 aa  144  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  26.65 
 
 		 519 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.71 
 
 		 504 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>