More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1560 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  61.67 
 
 		 519 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  59.3 
 
 		 521 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  81.47 
 
 		 520 aa  876    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 519 aa  1063    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  81.31 
 
 		 519 aa  880    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  68.53 
 
 		 519 aa  739    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  57.83 
 
 		 528 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  55.81 
 
 		 522 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  48.74 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  44.27 
 
 		 513 aa  475  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  41.7 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  41.67 
 
 		 516 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  40 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  39.42 
 
 		 527 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  40.08 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  31.56 
 
 		 481 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  30.33 
 
 		 492 aa  229  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.87 
 
 		 518 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  30.33 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  30.33 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  30.14 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  30.33 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  30.33 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  30.33 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  30.33 
 
 		 492 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.98 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.63 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.27 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.29 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.08 
 
 		 496 aa  204  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.63 
 
 		 512 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  27.61 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.35 
 
 		 512 aa  202  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.02 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.32 
 
 		 511 aa  200  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.88 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.16 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  28.38 
 
 		 506 aa  193  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  28.38 
 
 		 506 aa  193  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29.89 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.03 
 
 		 513 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30.47 
 
 		 499 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.83 
 
 		 513 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.78 
 
 		 506 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  27.42 
 
 		 515 aa  189  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.03 
 
 		 513 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.21 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.88 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  27.03 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.03 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  27.03 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.38 
 
 		 504 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  27.03 
 
 		 513 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.64 
 
 		 519 aa  187  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  27.06 
 
 		 513 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  27.18 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.66 
 
 		 481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.17 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.82 
 
 		 497 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  28.91 
 
 		 505 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.82 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.76 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  27.15 
 
 		 502 aa  178  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.52 
 
 		 489 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.92 
 
 		 514 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.64 
 
 		 512 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.12 
 
 		 514 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.04 
 
 		 530 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.05 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.3 
 
 		 498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.01 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.42 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.64 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.63 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.39 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.79 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  26.91 
 
 		 511 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  26.72 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.4 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.88 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  26.72 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  31.02 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  26.72 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  28.91 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  28.4 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  25.59 
 
 		 512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  25.25 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  27.01 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  28.92 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  28.24 
 
 		 495 aa  161  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  26.14 
 
 		 532 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  28.44 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  28.54 
 
 		 505 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  25.2 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  25.39 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.65 
 
 		 530 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  25.87 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  29.59 
 
 		 503 aa  159  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>