More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1009 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 513 aa  1061    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  53.25 
 
 		 516 aa  542  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  48.73 
 
 		 520 aa  535  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  46.72 
 
 		 519 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  44.27 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  44.08 
 
 		 520 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  44.08 
 
 		 519 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  45.51 
 
 		 519 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  47.24 
 
 		 517 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  43.02 
 
 		 521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  46.03 
 
 		 519 aa  468  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  43.33 
 
 		 528 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  43.39 
 
 		 522 aa  432  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  31.57 
 
 		 527 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  31.69 
 
 		 512 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.73 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.41 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  24.9 
 
 		 481 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.51 
 
 		 512 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.02 
 
 		 500 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.17 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.94 
 
 		 496 aa  200  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.53 
 
 		 502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.86 
 
 		 492 aa  197  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.86 
 
 		 492 aa  197  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.09 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.92 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  26.46 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  26.46 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  26.46 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  26.06 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  26.26 
 
 		 492 aa  193  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  26.26 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  26.26 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  26.26 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.31 
 
 		 509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  26.23 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.94 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  25.83 
 
 		 504 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.5 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.33 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.71 
 
 		 500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  27.12 
 
 		 511 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  28.57 
 
 		 511 aa  181  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  30.1 
 
 		 506 aa  181  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  26.17 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  26.59 
 
 		 498 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.74 
 
 		 512 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  26.64 
 
 		 508 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.99 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.21 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  28.35 
 
 		 488 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.16 
 
 		 513 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.16 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.16 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.46 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  27.92 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.16 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.96 
 
 		 513 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  27.96 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  24.3 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.8 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  27.5 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  26.77 
 
 		 519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.96 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.03 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.18 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  24.1 
 
 		 493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  24.1 
 
 		 493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  27.77 
 
 		 513 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  24.1 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  23.63 
 
 		 493 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  24.21 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  23.38 
 
 		 509 aa  161  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.84 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  24.01 
 
 		 493 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.64 
 
 		 505 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  24.56 
 
 		 548 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  25.15 
 
 		 489 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.67 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  26.17 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  25.29 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.73 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  24.76 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.49 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.27 
 
 		 530 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  23.89 
 
 		 509 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  23.85 
 
 		 538 aa  153  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  27.41 
 
 		 515 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  25.59 
 
 		 481 aa  153  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  27.37 
 
 		 514 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  25.63 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  26.07 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  23.15 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.47 
 
 		 512 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  24.02 
 
 		 493 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  23.29 
 
 		 487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.37 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  25.88 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>