More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1976 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 512 aa  1046    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  54.53 
 
 		 527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  40.08 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  39.22 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  38.36 
 
 		 519 aa  362  9e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  39.34 
 
 		 519 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  40.32 
 
 		 528 aa  353  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  37.94 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  37.76 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  36.01 
 
 		 522 aa  310  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  31.69 
 
 		 513 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  31.41 
 
 		 517 aa  299  7e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  34.26 
 
 		 516 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  32.81 
 
 		 520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  33 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  27.61 
 
 		 481 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  26.08 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  26.08 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  26.08 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  25.88 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  25.88 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  24.65 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  25.25 
 
 		 492 aa  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  25.45 
 
 		 492 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.48 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  26.61 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.62 
 
 		 509 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.95 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.03 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  27.87 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.62 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.66 
 
 		 500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.26 
 
 		 500 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.05 
 
 		 509 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  23.47 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.85 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.67 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  24.67 
 
 		 513 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  24.47 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.01 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.29 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.29 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  24.29 
 
 		 513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  24.29 
 
 		 513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  24.29 
 
 		 513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  22.35 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  26.88 
 
 		 497 aa  116  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  23.75 
 
 		 512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  26.62 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  27.5 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  24.02 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  24.53 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.01 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  24.02 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  23.28 
 
 		 512 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  27.57 
 
 		 492 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  27.57 
 
 		 492 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  26.76 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  25.39 
 
 		 505 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  26.8 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  24.38 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  25.05 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  25.34 
 
 		 504 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  22.83 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  22.82 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  22.82 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  24.81 
 
 		 498 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  25.98 
 
 		 506 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  26.38 
 
 		 503 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  26.9 
 
 		 495 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26.29 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  25.38 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  24.31 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  23.66 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  25.99 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  23.12 
 
 		 511 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  25.97 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  25.19 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  25.19 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  25.19 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24.27 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  25.19 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  25.19 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.62 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.23 
 
 		 497 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  25.68 
 
 		 521 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  23.26 
 
 		 512 aa  104  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.29 
 
 		 530 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  27.85 
 
 		 499 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  22.99 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  27.17 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  22.7 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  21.46 
 
 		 506 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  26.47 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  25.1 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.1 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  25.39 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  23.87 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>