More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2635 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  73.72 
 
 		 493 aa  715    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  73.92 
 
 		 493 aa  712    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  100 
 
 		 498 aa  1016    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  69.57 
 
 		 499 aa  685    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  58.22 
 
 		 496 aa  591  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  58.98 
 
 		 496 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  59.18 
 
 		 502 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  61.59 
 
 		 496 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  59.45 
 
 		 495 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  52.75 
 
 		 498 aa  545  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  54.24 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  50.82 
 
 		 498 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  46.39 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  45.84 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  32.12 
 
 		 492 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  32.12 
 
 		 492 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.8 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  38.03 
 
 		 463 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  38.69 
 
 		 458 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  37.93 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.05 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  37.98 
 
 		 482 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.93 
 
 		 500 aa  262  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.53 
 
 		 509 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  31.98 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  37.33 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  38.58 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.47 
 
 		 511 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.83 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  37.78 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  33.6 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  31.46 
 
 		 500 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.08 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  36.29 
 
 		 479 aa  247  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  36.51 
 
 		 480 aa  246  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  35.68 
 
 		 465 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.55 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  34.26 
 
 		 492 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.14 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  35.65 
 
 		 465 aa  240  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  35.55 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  35.09 
 
 		 465 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  37.27 
 
 		 493 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  37.27 
 
 		 493 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  35.09 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  33.33 
 
 		 499 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  35.09 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.9 
 
 		 485 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  32.89 
 
 		 494 aa  237  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  31.25 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.87 
 
 		 496 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  34.79 
 
 		 506 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  33.93 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.08 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.05 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.05 
 
 		 483 aa  230  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  34.83 
 
 		 511 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  32.87 
 
 		 493 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  37.14 
 
 		 460 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  34.59 
 
 		 504 aa  229  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.75 
 
 		 496 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  34.87 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  37.05 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  33.48 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  34.15 
 
 		 517 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  34.15 
 
 		 517 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  33.06 
 
 		 498 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  35.15 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.2 
 
 		 515 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.4 
 
 		 509 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  37.33 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  31.31 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  36.07 
 
 		 483 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  31.9 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  30.49 
 
 		 484 aa  223  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  33.56 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  37.59 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  33.27 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  35.03 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  37.91 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  33.61 
 
 		 506 aa  221  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  31.46 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  32.86 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  31.77 
 
 		 488 aa  220  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  35.97 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  37.35 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  34.09 
 
 		 487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  32.53 
 
 		 490 aa  218  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  30.91 
 
 		 484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  36.26 
 
 		 492 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  34.5 
 
 		 491 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.4 
 
 		 505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  34.25 
 
 		 492 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  35.03 
 
 		 482 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  36.26 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  36.03 
 
 		 492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  35.16 
 
 		 492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  36.03 
 
 		 492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  35.35 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.53 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>