More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3253 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  100 
 
 		 464 aa  909    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  57.85 
 
 		 465 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  59.56 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  59.45 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  58.55 
 
 		 482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  57.02 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  59.35 
 
 		 458 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  56.9 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  57.76 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  61.15 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  54.72 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  56.29 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  56.53 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  54.55 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  53.36 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  55.88 
 
 		 480 aa  438  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  56.24 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  54.88 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  54.88 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  54.88 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  55.46 
 
 		 486 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  56.49 
 
 		 482 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  55.37 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  57.24 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  53.15 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  56.62 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  53.88 
 
 		 495 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  47.32 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  55.04 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  47.95 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  51.93 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  44.35 
 
 		 540 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  43.97 
 
 		 493 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  43.75 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  43.75 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  38.46 
 
 		 510 aa  256  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  38.27 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  38.58 
 
 		 498 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  38.75 
 
 		 499 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  39.06 
 
 		 496 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  37.86 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  37.72 
 
 		 498 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  37.5 
 
 		 495 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  34.73 
 
 		 505 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  35.87 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  35.73 
 
 		 497 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  34.96 
 
 		 496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  37.64 
 
 		 496 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  37.86 
 
 		 502 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  31.9 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  31.9 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.26 
 
 		 518 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  34.02 
 
 		 496 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.31 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  36 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  35.03 
 
 		 484 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  35.03 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  35.03 
 
 		 484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.33 
 
 		 499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  30.77 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  30.39 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.15 
 
 		 493 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.26 
 
 		 501 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.48 
 
 		 493 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  34 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  35.6 
 
 		 490 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  35.6 
 
 		 490 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  35.6 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  35.6 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.87 
 
 		 502 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.75 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.35 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  34.51 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  36.58 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  36.58 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  36.58 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  34 
 
 		 485 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  34.53 
 
 		 492 aa  170  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.5 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.5 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  33.86 
 
 		 484 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.89 
 
 		 493 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  36.03 
 
 		 492 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.63 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  35.15 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  33.63 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.63 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  35.15 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  35.15 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.28 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  34.8 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  31.55 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  34.8 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  33.41 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  34.77 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  33.41 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.89 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.18 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  33.41 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.41 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>