More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2788 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  98.38 
 
 
493 aa  951    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  100 
 
 
493 aa  967    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  100 
 
 
493 aa  967    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  46.44 
 
 
463 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  49.21 
 
 
465 aa  293  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  44.38 
 
 
465 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  44.35 
 
 
458 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  44.51 
 
 
464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  45.15 
 
 
479 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  44.71 
 
 
492 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  43.75 
 
 
464 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  45.35 
 
 
482 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  45.9 
 
 
460 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  45.39 
 
 
480 aa  269  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  42.47 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  42.24 
 
 
480 aa  264  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  44.37 
 
 
465 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  44.37 
 
 
465 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  44.37 
 
 
465 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  39.09 
 
 
506 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  42.64 
 
 
475 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  40.14 
 
 
498 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  44.85 
 
 
486 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  42 
 
 
460 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  45.79 
 
 
469 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  42.31 
 
 
461 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  39.96 
 
 
490 aa  253  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  42.37 
 
 
480 aa  251  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  39.86 
 
 
463 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  39.57 
 
 
499 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  45.05 
 
 
482 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  42.32 
 
 
505 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  37.04 
 
 
493 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  43.22 
 
 
495 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  37.09 
 
 
496 aa  240  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  36.6 
 
 
498 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  42.13 
 
 
464 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  36.64 
 
 
510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  38.12 
 
 
495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  38.52 
 
 
496 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  38.52 
 
 
502 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  44.03 
 
 
479 aa  233  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  36.02 
 
 
493 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  36.54 
 
 
498 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  42.05 
 
 
472 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  38.76 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  33.56 
 
 
505 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  34.53 
 
 
499 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  36.01 
 
 
515 aa  203  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.86 
 
 
518 aa  193  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  34.39 
 
 
488 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.49 
 
 
500 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  33.99 
 
 
493 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  33.78 
 
 
503 aa  189  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.87 
 
 
493 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.48 
 
 
489 aa  187  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  35.45 
 
 
499 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  36.56 
 
 
493 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.24 
 
 
500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  36.17 
 
 
490 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  36.17 
 
 
490 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.96 
 
 
491 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  36.17 
 
 
490 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  36.17 
 
 
490 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.85 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  32.67 
 
 
493 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  35.65 
 
 
496 aa  177  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  35.62 
 
 
484 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.59 
 
 
492 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.59 
 
 
492 aa  176  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.75 
 
 
493 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.35 
 
 
487 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.99 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.99 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.13 
 
 
502 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.68 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.75 
 
 
493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  35.71 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  35.71 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  35.71 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  30.31 
 
 
496 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  35.71 
 
 
493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  33.41 
 
 
486 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  32.66 
 
 
497 aa  174  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.04 
 
 
488 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  32.89 
 
 
484 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.1 
 
 
497 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.36 
 
 
501 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  31.12 
 
 
494 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  34.64 
 
 
491 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  37.88 
 
 
492 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  37.88 
 
 
492 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  37.88 
 
 
492 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  36.64 
 
 
478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.14 
 
 
496 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  33.1 
 
 
485 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  33.81 
 
 
488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  33.81 
 
 
488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  36.26 
 
 
485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  35.65 
 
 
487 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>