More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4473 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  70.18 
 
 		 493 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  69.57 
 
 		 493 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  69.57 
 
 		 498 aa  695    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  100 
 
 		 499 aa  1011    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  63.27 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  63.06 
 
 		 496 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  64.49 
 
 		 496 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  57.95 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  61.52 
 
 		 495 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  54.3 
 
 		 498 aa  552  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  54.04 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  52.43 
 
 		 498 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  45.02 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  46.12 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  35.19 
 
 		 518 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  34.07 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  32.06 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  32.06 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  33.13 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.8 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.73 
 
 		 512 aa  262  8e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  35.35 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  35.74 
 
 		 463 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  36.68 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  38.16 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  39.41 
 
 		 493 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  39.41 
 
 		 493 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  36.81 
 
 		 504 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  38.53 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.86 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  34.15 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.15 
 
 		 509 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  36.4 
 
 		 499 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  33.86 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  36.42 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  36.59 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  37.83 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  37.22 
 
 		 482 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  35.8 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  39.18 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  34.48 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  33.95 
 
 		 485 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.53 
 
 		 501 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  33.74 
 
 		 484 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  37.44 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  36.79 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.59 
 
 		 496 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  33.33 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  33.33 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.85 
 
 		 498 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  34 
 
 		 489 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  35.85 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  34.08 
 
 		 484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  35.16 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  37.23 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  37.05 
 
 		 465 aa  237  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  36.11 
 
 		 466 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  37.18 
 
 		 511 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  35.56 
 
 		 475 aa  236  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  37.38 
 
 		 483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  34.71 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  30.41 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33 
 
 		 515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  36.45 
 
 		 517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  36.45 
 
 		 517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  38.95 
 
 		 490 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  35.41 
 
 		 465 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  38.95 
 
 		 490 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  36.99 
 
 		 492 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  36.99 
 
 		 492 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.18 
 
 		 509 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  31.69 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  35.41 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  35.41 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  38.72 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  38.72 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.42 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  36.99 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  35.37 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  38.3 
 
 		 493 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  35.98 
 
 		 480 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.81 
 
 		 493 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  37.55 
 
 		 492 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  36.47 
 
 		 493 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  38.62 
 
 		 493 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  38.62 
 
 		 493 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  38.62 
 
 		 493 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  29.96 
 
 		 494 aa  229  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  34.62 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  35.93 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  37.6 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  35.27 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  37.83 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  35.16 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  37.33 
 
 		 493 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  38.82 
 
 		 508 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  34.61 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  35.66 
 
 		 505 aa  226  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  35.4 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  34.57 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>