More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2036 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  75.6 
 
 		 496 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  75.1 
 
 		 502 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  100 
 
 		 496 aa  992    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  64.49 
 
 		 499 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  62.24 
 
 		 493 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  61.59 
 
 		 498 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  61.02 
 
 		 493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  52.45 
 
 		 496 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  52.67 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  56.48 
 
 		 495 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  50 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  51.12 
 
 		 498 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  44.4 
 
 		 510 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  42.86 
 
 		 497 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  40.94 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  39.37 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  39.08 
 
 		 469 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  39.73 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  39.78 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  36.17 
 
 		 512 aa  259  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  39.78 
 
 		 465 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  39.78 
 
 		 465 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  32.59 
 
 		 492 aa  259  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  32.59 
 
 		 492 aa  259  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  33.2 
 
 		 518 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  38.62 
 
 		 463 aa  257  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  39.91 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  39.55 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  30.94 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  39.29 
 
 		 464 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  40.04 
 
 		 461 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  34.34 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.59 
 
 		 500 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  32.28 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  37.47 
 
 		 482 aa  243  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.45 
 
 		 509 aa  243  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  35.85 
 
 		 492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  38.34 
 
 		 475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  36.1 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  37.1 
 
 		 463 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  38.36 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  38.86 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  38.86 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.54 
 
 		 501 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  34.38 
 
 		 506 aa  233  8.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  34.11 
 
 		 496 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  36.66 
 
 		 466 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  37.39 
 
 		 479 aa  229  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.03 
 
 		 509 aa  229  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  38.08 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  38.42 
 
 		 493 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  34.84 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  35.37 
 
 		 511 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  37.27 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.86 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  34.78 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.91 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  35.97 
 
 		 480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  36.69 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  34.68 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  33.73 
 
 		 484 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  34.68 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  36.8 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  36.9 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  35.95 
 
 		 480 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  34.27 
 
 		 484 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  32.46 
 
 		 488 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  35.32 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.66 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.19 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  35.86 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  37.5 
 
 		 496 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  36.67 
 
 		 495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  30.43 
 
 		 500 aa  216  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  33.99 
 
 		 485 aa  216  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  33 
 
 		 483 aa  216  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  33 
 
 		 483 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  37.3 
 
 		 478 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.16 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  33.94 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.59 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  32.19 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  36.47 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  37.72 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  36.3 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  34.32 
 
 		 505 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  35.74 
 
 		 499 aa  209  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  37 
 
 		 490 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  37 
 
 		 490 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  36.78 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  36.78 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  36.78 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  35.85 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  36.78 
 
 		 490 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.2 
 
 		 483 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  36.78 
 
 		 490 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  34.55 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  37.2 
 
 		 483 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  35.32 
 
 		 483 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.3 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>