More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2065 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  100 
 
 
479 aa  937    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  69.49 
 
 
463 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  67.08 
 
 
492 aa  588  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  68.14 
 
 
458 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  66.17 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  66.53 
 
 
465 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  67.91 
 
 
480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  65.42 
 
 
495 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  69.98 
 
 
482 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  67.09 
 
 
482 aa  566  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  69.79 
 
 
486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  68.14 
 
 
460 aa  562  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  65.16 
 
 
475 aa  558  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  68.37 
 
 
460 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  65.27 
 
 
480 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  63.42 
 
 
464 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  60 
 
 
480 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  59.02 
 
 
490 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  63.49 
 
 
479 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  61.06 
 
 
465 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  61.06 
 
 
465 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  61.06 
 
 
465 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  59.83 
 
 
461 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  60.22 
 
 
464 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  60.2 
 
 
505 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  60.08 
 
 
466 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  60.17 
 
 
469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  62.31 
 
 
472 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  54.72 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  48.32 
 
 
506 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  49.26 
 
 
463 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  42.23 
 
 
540 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  45.15 
 
 
493 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  45.15 
 
 
493 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  46.31 
 
 
493 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  36.05 
 
 
510 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  36.29 
 
 
498 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  36.03 
 
 
493 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  35.38 
 
 
498 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  34.69 
 
 
496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  36.88 
 
 
495 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  33.63 
 
 
496 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  36.29 
 
 
496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  36.52 
 
 
502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  34.35 
 
 
498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  34.55 
 
 
493 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  34.57 
 
 
499 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  32.84 
 
 
505 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  34.51 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.26 
 
 
518 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  33.64 
 
 
486 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.72 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.98 
 
 
492 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.98 
 
 
492 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  34.65 
 
 
493 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  36.62 
 
 
493 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  34.7 
 
 
490 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.76 
 
 
500 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  34.7 
 
 
490 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  34.7 
 
 
490 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  35.08 
 
 
493 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  34.7 
 
 
490 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  35.45 
 
 
493 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  35.81 
 
 
493 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  35.81 
 
 
493 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.45 
 
 
488 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.17 
 
 
501 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.51 
 
 
490 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  31.2 
 
 
492 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.59 
 
 
493 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  35.39 
 
 
488 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.19 
 
 
512 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  35.39 
 
 
488 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.05 
 
 
483 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  33.82 
 
 
493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  34.48 
 
 
493 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  34.48 
 
 
493 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  34.48 
 
 
493 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  31.38 
 
 
484 aa  166  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.06 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.91 
 
 
493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.34 
 
 
491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  35.38 
 
 
488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  34.1 
 
 
484 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  34.1 
 
 
484 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  34.1 
 
 
484 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  34.1 
 
 
484 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  34.1 
 
 
484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.18 
 
 
496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  34.18 
 
 
484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  32.09 
 
 
494 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  33.47 
 
 
493 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  35.79 
 
 
492 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  34.31 
 
 
491 aa  163  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  31.38 
 
 
484 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  35.66 
 
 
492 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  33.87 
 
 
484 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  35.66 
 
 
492 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  29.26 
 
 
494 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.87 
 
 
484 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>