More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2702 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  100 
 
 		 493 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  90.26 
 
 		 493 aa  886    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  73.72 
 
 		 498 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  70.18 
 
 		 499 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  60.61 
 
 		 496 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  57.35 
 
 		 498 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  58.16 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  57.55 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  61.02 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  59.66 
 
 		 495 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  56.2 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  49.8 
 
 		 498 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  45.98 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  45.84 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  33.4 
 
 		 500 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  31.72 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  31.72 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  33.14 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.66 
 
 		 509 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.58 
 
 		 512 aa  261  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.92 
 
 		 511 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  31.2 
 
 		 489 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  36.96 
 
 		 463 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  36.55 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.74 
 
 		 509 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  32.45 
 
 		 500 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.25 
 
 		 493 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.79 
 
 		 484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.16 
 
 		 501 aa  246  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  36.18 
 
 		 464 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.76 
 
 		 502 aa  246  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  37.5 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.87 
 
 		 504 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  36.78 
 
 		 482 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.05 
 
 		 493 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.24 
 
 		 494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.47 
 
 		 493 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.66 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  34.95 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.45 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  36.76 
 
 		 463 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  35.76 
 
 		 506 aa  239  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.12 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  35.96 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  35.96 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  34.15 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  35.96 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.21 
 
 		 498 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  32.25 
 
 		 489 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  37 
 
 		 478 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.45 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  35.02 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.14 
 
 		 499 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.12 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  35.81 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  35.75 
 
 		 461 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  31.47 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  36.77 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  39.02 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.65 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  36.34 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.33 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  34.67 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  36.34 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.92 
 
 		 493 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.92 
 
 		 493 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  34.08 
 
 		 465 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  35.89 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  30.96 
 
 		 484 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  31.44 
 
 		 484 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  36.92 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  33.4 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  36.92 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  34.97 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  36.7 
 
 		 490 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  36.7 
 
 		 490 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  32.73 
 
 		 491 aa  226  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  30.91 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  36.04 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.78 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  36.04 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  30.91 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  36.04 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  30.56 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  33.59 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  35.82 
 
 		 493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  36.96 
 
 		 483 aa  223  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  34.94 
 
 		 480 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  35.15 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  34.66 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  36.2 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  31.03 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  34.63 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.75 
 
 		 515 aa  219  8.999999999999998e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  34.07 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  33.97 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  33.47 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.87 
 
 		 484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  35.27 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  34.68 
 
 		 472 aa  217  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>