More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6686 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  100 
 
 		 460 aa  902    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  70.04 
 
 		 463 aa  594  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  68.37 
 
 		 479 aa  579  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  68.32 
 
 		 458 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  66.23 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  65.38 
 
 		 495 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  65.12 
 
 		 480 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  67.23 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  64.45 
 
 		 492 aa  549  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  66.96 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  64.52 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  65.09 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  65.07 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  68.57 
 
 		 482 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  63.98 
 
 		 480 aa  518  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  63.4 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  63.4 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  63.4 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  62.63 
 
 		 461 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  57.99 
 
 		 490 aa  508  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  63.01 
 
 		 466 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  60.74 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  59.54 
 
 		 480 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  62.58 
 
 		 479 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  60.43 
 
 		 475 aa  488  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  62.82 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  60.83 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  57.76 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  62.35 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  50.89 
 
 		 506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  51.85 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  45.53 
 
 		 540 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  44.24 
 
 		 493 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  44.24 
 
 		 493 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  45.11 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  38.64 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  37.78 
 
 		 498 aa  260  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  35.51 
 
 		 496 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  39.81 
 
 		 495 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  37.67 
 
 		 498 aa  243  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  37.36 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  33.06 
 
 		 505 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  37.98 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  35.32 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  35.26 
 
 		 493 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  37.28 
 
 		 496 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  35.71 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  36.2 
 
 		 496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  37.5 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.74 
 
 		 500 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.05 
 
 		 518 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.41 
 
 		 496 aa  203  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.81 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  36.7 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.9 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.9 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.2 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  37.32 
 
 		 498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  34.63 
 
 		 493 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.57 
 
 		 499 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  35.8 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  32.52 
 
 		 494 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  34.23 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.64 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  30.54 
 
 		 490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  37.59 
 
 		 488 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.64 
 
 		 493 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  37.35 
 
 		 488 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  33.26 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  37.35 
 
 		 488 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.35 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.42 
 
 		 489 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.8 
 
 		 506 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.02 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.02 
 
 		 493 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.02 
 
 		 493 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.6 
 
 		 509 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  34.36 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  33.75 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  33.49 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  31.48 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.88 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  36.45 
 
 		 488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  37.75 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  33.88 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.88 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.88 
 
 		 484 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  34.07 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  36.91 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  36.7 
 
 		 486 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  36.91 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  31.91 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  32.92 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  36.91 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  36.91 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  36.7 
 
 		 486 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  33.88 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  36.11 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  35.65 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  33.68 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>