More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  100 
 
 		 469 aa  920    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  66.31 
 
 		 461 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  65.36 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  64.76 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  65.3 
 
 		 458 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  62.72 
 
 		 465 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  60.17 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  62.82 
 
 		 460 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  61.16 
 
 		 465 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  58.07 
 
 		 495 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  60.95 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  61.43 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  61.15 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  61.43 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  57.96 
 
 		 492 aa  477  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  61.2 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  59.31 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  60.87 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  59.83 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  61.28 
 
 		 486 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  57.29 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  60.57 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  57.31 
 
 		 475 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  54.64 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  57.51 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  55.79 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  58.91 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  56.67 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  52.02 
 
 		 490 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  48.99 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  53.49 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  47.38 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  41.69 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  38.96 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  46.29 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  46.29 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  38.6 
 
 		 498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  46.27 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  38.15 
 
 		 496 aa  269  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  39.05 
 
 		 493 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  38.31 
 
 		 498 aa  262  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  36.67 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  38.75 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  38.74 
 
 		 496 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  36.32 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  35.63 
 
 		 493 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  38.34 
 
 		 496 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  38.57 
 
 		 502 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  33.4 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.53 
 
 		 500 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.27 
 
 		 518 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.87 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.69 
 
 		 492 aa  183  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.69 
 
 		 492 aa  183  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.38 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.6 
 
 		 496 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  33.42 
 
 		 488 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  33.57 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  33.41 
 
 		 484 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  32.62 
 
 		 486 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  33.41 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  33.41 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  34.9 
 
 		 488 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  33.58 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  34.9 
 
 		 488 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  36.96 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  36.96 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  36.96 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.09 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  36.71 
 
 		 484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  34.65 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  31.3 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  34.65 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  36.71 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.31 
 
 		 489 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  36.17 
 
 		 484 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  34.98 
 
 		 482 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.41 
 
 		 499 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  33 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  33 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  31.29 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  36.87 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.56 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  32.87 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  35.99 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.56 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  32.8 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  33 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.14 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.56 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.11 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  30.89 
 
 		 486 aa  170  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  33.8 
 
 		 493 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  33.8 
 
 		 493 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.11 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  34.86 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.11 
 
 		 493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  32.59 
 
 		 484 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.64 
 
 		 504 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.22 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>