More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3559 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  100 
 
 		 510 aa  1047    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  49.38 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  47.26 
 
 		 493 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  45.6 
 
 		 498 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  45.98 
 
 		 493 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  47.47 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  45.02 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  46.39 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  46.39 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  46.71 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  43.39 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  45.36 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  43.6 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  44.4 
 
 		 496 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  39.09 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  38.31 
 
 		 518 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  39.8 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  39.65 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  38.99 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  38.28 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  38.89 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  36.51 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  36.51 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  37.48 
 
 		 501 aa  294  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  37.38 
 
 		 502 aa  294  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  39.92 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  38.09 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  39.6 
 
 		 506 aa  286  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  36.58 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  38.34 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  40.14 
 
 		 496 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  33.4 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  34.94 
 
 		 499 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  39.28 
 
 		 458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  39.23 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  38.63 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  37.4 
 
 		 491 aa  266  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  35.83 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  36.89 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  39.23 
 
 		 493 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  39.23 
 
 		 493 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  36.67 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  39 
 
 		 493 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  37.44 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  37.89 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  33.98 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.7 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.55 
 
 		 494 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  38.01 
 
 		 505 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  35.5 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  35.5 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  35.32 
 
 		 500 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  35.33 
 
 		 491 aa  256  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  35.61 
 
 		 515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  32.81 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  36.23 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  35.19 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  37.28 
 
 		 493 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  37.13 
 
 		 484 aa  253  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  38.64 
 
 		 460 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  34.22 
 
 		 517 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  36.09 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  37.12 
 
 		 490 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  37.67 
 
 		 486 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  37.12 
 
 		 490 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  37.12 
 
 		 490 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  34.03 
 
 		 517 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  37.12 
 
 		 490 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  35.75 
 
 		 475 aa  249  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  36.93 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  38.32 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  38.37 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  36.93 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  36.93 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  36.02 
 
 		 482 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  36.09 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  36.12 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  36.12 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  38.41 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  39.29 
 
 		 486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  36.12 
 
 		 465 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  31.69 
 
 		 496 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  37.47 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  35.2 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  35.33 
 
 		 484 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  35.54 
 
 		 484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  37.15 
 
 		 484 aa  243  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  36.92 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  36.92 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  34.85 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  37 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  37.12 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  36.78 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  34.85 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  36.92 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  37.15 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  36.67 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  35.61 
 
 		 492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  37.81 
 
 		 483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  35.78 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>