More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2285 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  100 
 
 		 505 aa  1046    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  56.5 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  56.2 
 
 		 493 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  55.28 
 
 		 493 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  54.04 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  55.11 
 
 		 495 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  53.91 
 
 		 498 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  50.2 
 
 		 498 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  49.08 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  48.38 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  50 
 
 		 496 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  46.52 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  46.39 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  42.43 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  33.98 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  34.62 
 
 		 500 aa  280  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  36.08 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  33.26 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.23 
 
 		 509 aa  259  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  35.56 
 
 		 499 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  32.33 
 
 		 500 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  35.92 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.81 
 
 		 512 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  35.6 
 
 		 469 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  31.59 
 
 		 492 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  31.59 
 
 		 492 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.42 
 
 		 501 aa  246  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  34.11 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.13 
 
 		 496 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  34.88 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  33.78 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  33.66 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  33.55 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  33.6 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  34.3 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.22 
 
 		 515 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  33.99 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.43 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.71 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  35.04 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  33.54 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  31.83 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  32.85 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  32.09 
 
 		 490 aa  226  9e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  32.99 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  32.23 
 
 		 496 aa  224  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  33.13 
 
 		 478 aa  223  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  34.19 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  32.39 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  31.57 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  32.37 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  31.57 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  31.57 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  33.94 
 
 		 511 aa  220  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.28 
 
 		 484 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  32.84 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  33.41 
 
 		 472 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.37 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  31.26 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.14 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  34.08 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.14 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  34.08 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.41 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.41 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  30.71 
 
 		 480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  33.56 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.29 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  33.18 
 
 		 463 aa  216  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  36.73 
 
 		 482 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33 
 
 		 483 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  31.69 
 
 		 482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  30.16 
 
 		 489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  30.6 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  31.35 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  33.05 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  31.9 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  33.12 
 
 		 492 aa  209  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  31.01 
 
 		 484 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  33.71 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  32.31 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  32.32 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  34.08 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  31.7 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  31.06 
 
 		 460 aa  207  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  31.82 
 
 		 493 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  32.71 
 
 		 478 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  30.52 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  33.33 
 
 		 493 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  34.17 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  30.65 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  33.41 
 
 		 478 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  34.45 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.23 
 
 		 493 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.23 
 
 		 493 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.23 
 
 		 493 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  29.38 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  31.7 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  31.86 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  33.41 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>